أحماض أمينية غير مركبة للپروتينات
في الكيمياء الحيوية، الأحماض الأمينية الغير مشفرة أوالغير مركبة للپروتينات، هي تلك الأحماض الغير مشفرة طبيعياً أوالموجودة في الشفرة الوراثية لأي عضية.
بالرغم من استخدام 22 حمض أميني فقط (21 في حقيقيات النوى) بواسطة الآلية المتعدية لتجميع الپروتينات (الأحماض الأمينية المركبة للپروتينات)، إلا حتى هناك أكثر من 140 حمض أميني يعهد بوجوده طبيعياً في الپروتينات وآلاف أخرى قد تتواجد أويتم تخليقها في المعمل. الكثير من الأحماض الأمينية الغير مركبة للپروتينات جديرة بالملاحظة لأنها:
- وسيطة في التخليق الحيوي.
- تتشكل في فترة ما بعد الترجمة في الپروتينات.
- تلعب دوراً فسيولوجياً (مثل مكونات الجدر الخلوية الجرثومية)، النواقل العصبية، والذيفان.
- المركبات الدوائية الطبيعية أوالاصطناعية
- التواجد في النيازك وفي تجارب التولد التلقائي (مثل تجربة ميلر-أوري).
التعريف حسب النفي
التسمية
الأحماض الأمينية الطبيعية والأحماض الأمينية-L-α
غير-ألفا
β-alanine: an amino acid produced by aspartate 1-decarboxylase and a precursor to coenzyme A and the peptides carnosine and anserine.
γ-Aminobutyric acid (GABA): a neurotransmitter in animals.
δ-Aminolevulinic acid: an intermediate in tetrapyrrole biosynthesis (haem, chlorophyll, cobalamin etc.).
4-Aminobenzoic acid (PABA): an intermediate in folate biosynthesis
الأحماض الأمينية-د
بدون هيدروجين على كربون-α
ألانين
aminoisobutyric acid
dehydroalanine
المراكز الفراغية للحمض الأميني التوأم
سيستين
cystathionine
lanthionine
Djenkolic acid
Diaminopimelic acid
الأحماض الأمينية المتولدة تلقائياً والكيمياء الحيوية البديلة
| تناسب الأحماض الأمينية بالنسبة للگليسين (%) | ||
|---|---|---|
| الجزيء | التفريغ الكهربي | نيزك مورشيسون |
| گليسين | 100 | 100 |
| ألانين | 180 | 36 |
| α-Amino-n-butyric acid | 61 | 19 |
| نورڤالين | 14 | 14 |
| ڤالين | 4.4 | |
| نورلوسين | 1.4 | |
| لوسين | 2.6 | |
| إيسولوسين | 1.1 | |
| Alloisoleucine | 1.2 | |
| t-leucine | < 0.005 | |
| α-Amino-n-heptanoic acid | 0.3 | |
| پرولين | 0.3 | 22 |
| Pipecolic acid | 0.01 | 11 |
| α,β-diaminopropionic acid | 1.5 | |
| α,γ-diaminobutyric acid | 7.6 | |
| Ornithine | < 0.01 | |
| ليسين | < 0.01 | |
| حمض الأسپارتيك | 7.7 | 13 |
| حمض الگلوتاميك | 1.7 | 20 |
| سيرين | 1.1 | |
| ثريونين | 0.2 | |
| ألوثريونين | 0.2 | |
| ميثيونين | 0.1 | |
| هوموسيستين | 0.5 | |
| هوموسيرين | 0.5 | |
| β-ألانين | 4.3 | 10 |
| β-Amino-n-butyric acid | 0.1 | 5 |
| β-Aminoisobutyric acid | 0.5 | 7 |
| γ-Aminobutyric acid | 0.5 | 7 |
| α-Aminoisobutyric acid | 7 | 33 |
| isovaline | 1 | 11 |
| Sarcosine | 12.5 | 7 |
| N-ethyl glycine | 6.8 | 6 |
| N-propyl glycine | 0.5 | |
| N-isopropyl glycine | 0.5 | |
| N-methyl alanine | 3.4 | 3 |
| N-ethyl alanine | < 0.05 | |
| N-methyl β-alanine | 1.0 | |
| N-ethyl β-alanine | < 0.05 | |
| إيسوسيرين | 1.2 | |
| α-hydroxy-γ-aminobutyric acid | 17 |
السلسلة الجانبية المستقيمة
Glycine (Hydrogen side-chain)
Alanine (Methyl side-chain)
α-aminobutyric acid (Ethyl side-chain)
Norvaline (n-Propyl side-chain)
Norleucine (n-Butyl side-chain)
Homonorleucine (n-Pentyl side-chain)
الكالكوگين
الشفرة الوراثية الممتدة
المهام
المدمجة بعد الترجمة في الپروتين
Carboxyglutamic acid. Whereas glutamic acid possess one γ-carboxyl group, Carboxyglutamic acid possess two.
Hydroxyproline. This imino acid differs from proline due to a hydroxyl group on carbon 4.
Hypusine. This amino acid is obtained by adding to the ε-amino group of a lysine a 4-aminobutyl moiety (obtained from spermidine)
Pyroglutamic acid
النظائر السامة
Thialysine
Quisqualic acid
Canavanine
azetidine-2-carboxylic acid
Cephalosporin C
Penicillamine
الأحماض الغير أمينية
الهوامش
- ^ plus formylmethionine in eukaryotes with prokaryote organelles like mitochondria
المصادر
- ^ Ambrogelly, A.; Palioura, S.; Söll, D. (2007). "Natural expansion of the genetic code". Nature Chemical Biology. 3 (1): 29–35. doi:10.1038/nchembio847. PMID 17173027.
- ^ Chakauya, E.; Coxon, K. M.; Ottenhof, H. H.; Whitney, H. M.; Blundell, T. L.; Abell, C.; Smith, A. G. (2005). "Pantothenate biosynthesis in higher plants". Biochemical Society Transactions. 33 (4): 743–746. doi:10.1042/BST0330743. PMID 16042590.
