فهم أحياء الأنظمة

مثال من أبحاث فهم أحياء الأنظمة.

فهم أحياء الأنظمة أوبيولوجيا الأنظمة Systems biology مصطلح يستعمل بشكل واسع في العلوم الحيوية biosciences، بشكل خاص بدءا من عام 2000 ضمن سياقات مختلفة. ومن أبرز الخصائص لهذا الفهم هي المقاربة الرياضياتية للبيولوجيا حيث يتم عمل نماذج رياضياتية عن مختلف الظواهر البيولوجية ومحاولة استعمالها في المحاكات. عادة ما تكون النماذج تعبير عن تفاعلات كميائية مرتبطة بعضها ببعض (شبكة تفاعلات). أحد الأمثلة هودراسة الأبوبتوزيس أي الموت الخلوي والأنظمة المتحكمة فيه من مستوى الجينات إلى مستوى طريقة قرائتها وتفعيلها (كميائيا)

المجالات المقترنة بفهم أحياء الأنظمة

استعراض سبل توصيل الإشارة

انظر أيضا

حياة اصطناعية Artificial life
هندسة الأنظمة الحيوية Biological systems engineering
سيبرنيتيك طبي حيوي Biomedical cybernetics
إحصاء حيوي Biostatistics
فهم الأحياء الحاسوبي Computational Biology
فهم أحياء الأنظمة الحاسوبي Computational systems biology
محاكاة حاسوبية Computer simulation
شبكة التنظيم الجينية Gene regulatory network
قائمة مواضيع الأوميات في فهم الأحياء List of omics topics in biology

قائمة مجموعات البحث في فهم أحياء الأنظمة List of Systems Biology Research Groups
نمذجة الشبكة الاستقلابية Metabolic network modelling
نموذج
فحص النموذج وفهم أحياء الأنظمة Model checking and systems biology
نظرية الشبكة للشيخوخة Network Theory of Aging
Regulome
فهم الأحياء التخليقي Synthetic biology
لغة تأشير فهم احياء الأنظمة Systems Biology Markup Language
فهم بيئة الأنظمة Systems ecology
نظرية الأنظمة Systems theory
شبكة التفاعل

المراجع

منشورات

خط

H Kitano (editor). Foundations of Systems Biology. MIT Press: 2001. ISBN 0-262-11266-3
CP Fall, E Marland, J Wagner and JJ Tyson (Editors). "Computational Cell Biology." Springer Verlag: 2002 ISBN 0-387-95369-8
G Bock and JA Goode (eds).In Silico" Simulation of Biological Processes, Novartis Foundation Symposium 247. John Wiley & Sons: 2002. ISBN 0-470-84480-9
E Klipp, R Herwig, A Kowald, C Wierling, and H Lehrach. Systems Biology in Practice. Wiley-VCH: 2005. ISBN 3-527-31078-9
L. Alberghina and H. Westerhoff (Editors) – Systems Biology: Definitions and Perspectives, Topics in Current Genetics 13, Springer Verlag (2005), ISBN 978-3-540-22968-1
A Kriete, R Eils. Computational Systems Biology., Elsevier - Academic Press: 2005. ISBN 0-12-088786-X
K. Sneppen and G. Zocchi, (2005) Physics in Molecular Biology, Cambridge University Press, ISBN 0-521-84419-3
D. Noble, Oxford University Press 2006. ISBN 0-19-929573-5, ISBN 978-0-19-929573-9
Z. Szallasi, J. Stelling, and V.Periwal (eds.) System Modeling in Cellular Biology: From Concepts to Nuts and Bolts (Hardcover), MIT Press: 2006, ISBN 0-262-19548-8
B Palsson, Cambridge University Press: 2006. ISBN 978-0-521-85903-5
K Kaneko. Life: An Introduction to Complex Systems Biology. Springer: 2006. ISBN 3-540-32666-9
U Alon. An Introduction to Systems Biology: Design Principles of Biological Circuits. CRC Press: 2006. ISBN 1-58488-642-0 - emphasis on Network Biology (For a comparative review of Alon, Kaneko and Palsson see)

منطقات

M. Tomita, Hashimoto K, Takahashi K, Shimizu T, Matsuzaki Y, Miyoshi F, Saito K, Tanida S, Yugi K, Venter JC, Hutchison CA. E-CELL: Software Environment for Whole Cell Simulation. Genome Inform Ser Workshop Genome Inform. 1997;8:147-155. [1]
ScienceMag.org - Special Issue: Systems Biology, Science, Vol 295, No 5560, March 1, 2002
Marc Vidal and Eileen E. M. Furlong. Nature Reviews Genetics 2004 From OMICS to systems biology
Marc Facciotti, Richard Bonneau, Leroy Hood and Nitin Baliga. Current Genomics 2004 Systems Biology Experimental Design - Considerations for Building Predictive Gene Regulatory Network Models for Prokaryotic Systems
Katia Basso, Adam A Margolin, Gustavo Stolovitzky, Ulf Klein, Riccardo Dalla-Favera, Andrea Califano, (2005) "Reverse engineering of regulatory networks in human B cells". Nat Genet;37(4):382-90
Mario Jardon Systems Biology: An Overview - a review from the Science Creative Quarterly, 2005
Johnjoe McFadden, Guardian.co.uk - 'The unselfish gene: The new biology is reasserting the primacy of the whole organism - the individual - over the behaviour of isolated genes', The Guardian (May 6, 2005)
WTEC Panel Report on International Research and Development in Systems Biology (2005)
E. Werner, "The Future and Limits of Systems Biology", Science STKE 2005, pe16 (2005).
Francis J. Doyle and Jörg Stelling, "Systems interface biology" J. R. Soc. Interface Vol 3, Noعشرة 2006
E. Werner, "All systems go", "Nature" vol 446, pp 493–494, March 29, 2007. (Review of three books (Alon, Kaneko, and Palsson) on systems biology.)
Santiago Schnell, Ramon Grima, Philip K. Maini, "Multiscale Modeling in Biology", American Scientist, Vol 95, pages 134-142, March-April 2007.

وصلات خارجية

Molecular Systems Biology - open access journal on systems biology
BMC Systems Biology - open access journal on systems biology
IET Systems Biology - not open access journal on systems biology
BIOREL resource for quantitative estimation of the gene network bias in relation to available database information
Biology sites
Systems Biology - BioChemWeb.org
Systems Biology Portal - administered by the Systems Biology Institute
Systems Biology Portal of Germany - administered by HepatoSys, the German competence network for Systems Biology of liver cells
Systems Biology Summit - Annual Systems Biology Summit held in Richmond, Virginia, hosted by Virginia Commonwealth University