تداخل الحمض النووي الريبوزي

Lentiviral delivery of designed shRNA's and the mechanism of RNA interference in mammalian cells.

تداخل RNA أوتداخل الحمض النووي الريبي - (RNA)- هوعملية بيولوجية يتم من خلالها تثبيط التعبير الجيني في جزيئات الرنا، ويحدث عادة بسبب تخريب جزيئات محددة في ناقل الشفرة الوراثية (mRNA) وقد عهدت هذه العملية تاريخياً بأسماء أخرى مثل " المشاركة في الإعاقة" و" سكون جينات مابعد النسخ" و"التهدئة" إلى حتى تم فهم هذه العملية بعدما كانت تبدوغير مترابطة، وأصبح جلياً أنها تصف ظاهرة "تداخل الرنا". في عام 2006 تشارك آندروفاير وكريغ فيلوجائزة نوبل في الفسيولوجيا -فهم وظائف الأعضاء- أوالطب عن دراسة نشراها في العام 1998 وقدما فيها بحثاً عن تداخل الرنا في الربداء الرشيقة إحدى الديدان الخيطية.

يوجد نوعين لجزيئات الحمض الريبي النووي الصغيرة (RNA) والتي تشكّل أساساً لعملية تداخل الرنا وهي جزيئات الحمض النووي الريبي الميكروية (miRNA) وجزيئات الحمض النووي الريبي المتداخلة الصغيرة (siRNA)، تعدّ الرناوات منتجات مباشرة للجينات، وبذلك تتمكن جزيئات الرناوات الصغيرة من الإرتباط بجزيئات محددة من مرسال الرنا مما يؤثر عليها إما بزيادة أوتقليل نشاطها، ومثال على ذلك منع مرسال الرنا من إنتاج البروتين. إذا عملية تداخل الرنا لها دور مهم في الدفاع عن الخلايا ضد سلاسل النوكليوتيد الطفيلي أي الفيروسات والنيقولات، كما حتى لها دور في توجيه عملية النماء (التطور) كما هودورها في التعبير الجيني بشكل عام.

العملية الخلوية

The dicer protein from Giardia intestinalis, which catalyzes the cleavage of dsRNA to siRNAs. The RNase domains are colored green, the PAZ domain yellow, the platform domain red, and the connector helix blue.[1]

تداخل الحمض النووي الريبي (RNAi) هوعملية سكون الجينات التابعة للحمض النووي الريبي (RNA) والتي ينظمها الحمض النووي الريبي الذي يزيد من هدوء وسكون المركب (RISC) ، وكذلك هي العملية التي ابتدأتها جزئيات الحمض النووي الريبي القصيرة والمجدولة ازدواجياً في سيتوبلازم الخلية حيثما تتفاعل مع المكونات المحفزة للحمض النووي الريبي المؤدي لسكون المركب المعقد (RISC) .

عندما تكون جزئيات الحمض النووي المزدوجة والمجدولة مع بعضها (dsRNA) خارجية أي قادمة من عدوى عن طريق فيروس مع جينات الحمض النووي الريبي أومن تلاعب في المختبر , فإنه يتم استيراد الحمض النووري الريبي (RNA) مباشرة من السيتوبلازم والمنشطر إلى أجزاء قصيرة بواسطة الإنزيم ، وكذلك عند بداية جزيئات الحمض النووري الريبي المزدوجة والمجدولة مع بعضها (dsRNA) يمكنها حتى تكون باطنية النموبأنقد يكون منشأها داخل الخلية كما هوالحال في بداية الأحماض النووية الريبية الصغيرة (microRNAs) التي تبدي النمط الظاهري من ترميز الجينات في مجموعة العوامل الوراثية ؛ وسلسلة الحمض النووي الريبي (RNA) الأولية من جينات هائلة هي أول عملية لتنظيم هيكل الحلقة الجذعية المميز في بداية الأحماض النووية الريبية الصغيرة (microRNAs) في النوية ، ثم يخرج إلى السيتوبلازم ليكون منشطر بواسطة إنزيم دايسر (Dicer) ، ولهذا فإن كلا الطريقتين الداخلية والخارجية تتلاقيان في مركب الحمض النووي الريبي المؤدي لسكون المركب .

انشطار الحمض النووي الريبي المزدوج (dsRNA)

الحمض النووي الريبي المزدوج الباطني (dsRNA) يحفز تداخل الحمض النووي الريبي (RNAi) ( وهوعملية بيولوجية التي تمنع جزيئات RNA من التغير الجيني) عن طريق تفاعل الإنزيم دايسر (Dicer) الذي يعمل على تشكيل رابطة كيميائية وانشطار الأجزاء الصغيرة المنتجة مباشرة من الحمض النووي الريبي المزودج (dsRNA) لتنتج سلاسل مزدوجة منفصلة إلى 20-25 أزواج رئيسية مع ثنائي النواة وتكون متصلة في آخر الجزء الثالث. وقد اقترحت الدراسات الحيوية على المعلومات الوراثية للكائنات الثنائية أشارت إلى حتى هذا الطول يزيد الجين المستهدف خصوصا ويقلل التأثيرات الغير محددة. وتسمى تلك السلاسل المزدوجة المنفصلة بالأحماض النووية الريبية صغيرة التداخل (siRNA) وهذه الخلايا الثنائية القصيرة يتم فصلها بعد ذلك إلى أحادية البنية ودمجها مع الحمض النووي الريبي المعقد الذي يزيد من سكون المركب (RISC) وبعد الاندماج في الحمض النووي الريبي الزائد من سكون المركب (RISC) ،زوجان أساسيان من الحمض النووي الريبي صغير التداخل (siRNAs) وفقاً لناقل الشفرة الوراثية (mRNA) ويزيد من إنتاجية انقسام الناقل (mRNA) وبالتالي يمنع من استخدامها في عملية تصنيع البروتين

والحمض النووي الريبي المزدوج خارجي النمومحمي ومترابط بواسطة بروتين مستجيب يعهد بـ(RDE-4) في الديدان الخيطية وبـ (R2D2) في الذباب الصغير والذي يحفز من فعالية إنزيم دايسر (dicer) وهذا البروتين الوحيد التي يرتبط على طول الحمض النووي الريبي المزدوج dsRNAs)) ولكن الطريقة المتبعة تنتج هذا الطول تحديدا كالغير معروف ويسهل كذلك من نقل أجزاء الحمض النووي الريبي صغير التداخل (siRNA) إلى الحمض النووي الريبي المعقد (RISC) This RNA-binding protein then facilitates the transfer of cleaved siRNAs to the RISC complex.

في الديدان الخيطية بدأ هذه العملية يتزايد عن طريق هجريب مجاميع الحمض النووي الريبي صغير التداخل الثانوي (siRNAs ) خلال عملية إنتاج إنزين دايسر أو الحمض النووي الريبي صغير التداخل الأولي (siRNAs) الذي يستخدم كجزيئات . والحمض النووي الريبي صغير التداخل الثانوي مختلف تماماً عن إنتاج الحمض النووي الريبي صغير التداخل لإنزيم دايسر ويظهر لينتج عن طريق الحمض النووي الريبي المعتمد على البلمرة_الحمض النووي الريبي المنتسخ_ (RdRP) .

الأحماض النووية الريبية الصغيرة

The stem-loop secondary structure of a pre-microRNA from Brassica oleracea.

يعمل الحمض النووي الريبي الصغير (miRNA) على ترميز الرنا غير المرمز بطريقة جينومية وهذا بدوره يساعد على ضبط التعبير الجيني وخصوصاً أثناء عملية النماء. إذا ظاهرة تداخل الرنا بصورة عامة تتضمن تأثيرات إسكات الجينات المحرضة المتطورة طبيعياً في ميكروالرنا وكذلك آثار الاسكات عن طريق رنا ذونطاقين غريب. إذا الميكرورنا الناضج مماثل في هجريبته للرنا المتدخل الصغير الذي ينتج من رنا ذي نطاقين خارجي، ولكن قبل وصول الميكرورنا للنضج فإنه يجب حتى يجتاز عملية معالجة الرنا ( تحويل النسخة الأولية). إذا الميكرورنا يعبر عنه بترميز جيني أكثر طولاً كنسخة أولية تعهد بـ "الميكرورنا الأولي" الذي يتم معاجته في نواة الخلية بواسطة معالجات دقيقة معقدة لتحوله إلى ما يسمّى ب "الميكرورنا السابق" الذي يتكون من 70 نيوكليتيد ذوهجريب حلقي جذعي. هذه المكونات المغقدة لإنزيم الريبوكلياز تسمى بروتين دروشا وبروتين باشا (DGCR8) . إذا بروتين الحمض النووي الريبي المزدوج لهذا "الميكرورنا السابق"قد يكون مرتبط وملتصق بإنزيم دايسر لينتج جزيء الميكرورنا الناضج التي يمكن حتى يندمج مع (الرنا-مركب الاسكات والتحفيز) إلى غير ذلك فإن الميكرورنا والرنا المتدخل الصغير يتشاركان نفس آلية المجرى السفلي الخلوية في عملية المعالجة الأولية.

إن الرنا المتدخل الصغير ينشأ من مجموعة سابقة طويلة من الرنا ذي النطاقين تختلف عن الميكرورنا في ذلك الميكرورنا ، وخاصة في الحيوانات، عادةقد يكون فيهم ازدواج القواعد غير مكتمل وذلك بهدف منع ترجمة مراسيل رنا كثيرة مختلفة بنفس المتتاليات. وفي اللقاءقد يكون زوج القوعد في الرنا المتدخل الصغير مكتملاً ويحث مرسال الرنا على الإنقسام في هدف محدد ومنفرد. في ذبابة الفاكهة وفي الربداء الرشيقة يعالج الميكرورنا والرنا المتدخل الصغير بواسطة بروتينات محفزة مستقلة وبزاسطة انزيم دايسر..

تنشيط وتحفيز RISC

Left: A full-length argonaute protein from the archaea species Pyrococcus furiosus. Right: The PIWI domain of an argonaute protein in complex with double-stranded RNA.

تعتبر أنزيمات الإندونيوكليزيز endonucleases المركب النشط والذيقد يكون (RISC) وهي ماتسمى ببروتينات الأرجونات argonaute proteins والتي تقوم بعملية شطر خيط الحامض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) المستهدف والمكمل لـ (si RNA). تكون الخيوط العشوائية الناتجة تعبير عن خيوط مزدوجة. ونظريا يمكن لهذه الخيوط انتاج (si RNA). لكن واحد فقط من هذه الخيوط والذي يعهد باسم الخيط القائد يمكنه حتى يرتبط ببروتين الأرجونات ويقوم بعملية إسكات الجين. أما الخيط الثاني والمضاد للخيط القائد فإنه يحدث له عملية تحلل أثناء تفعيل (RISC). وان كان يعتقد في البدء حتى أنزيم الهيليكاز والمعتمد على مركب أدونيسين ثلاثي الفوسفات ( ATP-dependent helicase ) هوالذي يقوم بعملية فصل الخيطين,, ولكن في الواقع فإن هذه العمليةلا تعتمدإطلاقا على مركب (ATP) وتنشط بعمل التراكيب البروتينية في (RISC). ومع ذلك فإن التجارب المعملية على ميكانيكية عمل (RNAi) في وجود مركب (ATP) من عدمه أشارت إلى حتى مركب (ATP) قد يحتاج وجوده في عملية الفصل بين الخيطين المكونة للحامض النووي الريبوزي الرسول (mRNA) وإزالته من مركب (RISC) بعد عملية التفاعل. والخيط الذي تم اختياره ليكون الخيط القائد تتميز نهايته 5' بعدم ثباتها وارتباطها بمكملها, لكن عملية اختيار الخيط لاتعتمد على الاتجاه الذي تتم فيه عملية إنشطار الخيط المزدوج من (ds RNA), وقبل التحامه مع مركب (RISC). وبدلا من ذلك قد يقوم بروتين (R2D2) بمثابة عامل التفريق حيث يرتبط بالنهاية 5' في الخيط المكمل للخيط القائد.

هيولي – الخلية وقد تم اقتباس هذا المصطلح من الصفحة العربية له في ويكيبيديا

تمت دراسة الأسس الهيكلية اللازمة لربط RNA مع البروتين الأرجونتي عن طريق دراسة البلورات بالأشعة السينية لمجال ارتباط RNA بالبروتين الأرجونتي. يدخل حينها الطرف الخامس من RNA والمتحول إلى فسفور في السطح الجيبي الأساسي المحجوز، الذي يقوم بالاتصال من خلال الأيون الديفلنتي ( ذرة بشحنتين موجبتين ) مثل المغنيزيوم وذلك عن طريق الاصطفاف العطري ( عملية كيميائية تسمح لأكثر من ذرة بمشاركة الكترون وذلك عن طريق إرساله واستقباله بشكل متكرر) بين النيكلوتيد رقمخمسة في RNA وبقايا التريزيون .

من المتسقط حتى هذا المسقط هوالذي يشكل مسقط التحول إلى نيكلوتيد والذي يتم فيه ارتباط siRNA بال miRNA الهدف. أظهرت الدراسة التحليلية للتأثير المكتسب للأزواج المترابطة عن طريق الخطأ في النهاية الخامسة أوالثالثة للنهاية الجزيئية تحت الدراسة حتى الحد الخامس هوالمسؤول عن الارتباط والتزواج في الناقل للشفرة الوراثية ، بينما الحد الثالث هوالمسؤول عن الترتيب الفيزيائي للطرف الثالث الهدف الذي يساهم في تشكيل منطقة الريسك لصالح عملية الفصل في miRNA .

من غير الواضح حتى الآن كيفية اكتشاف مركب الريسك الفعَال مكان تواجد miRNA التكميلي في الخلية. بالرغم من أنَ عملية الفصل قد يتم افتراض حدوثها بسبب عملية تحول الناقل للشفرة الوراثية (mRNA) والتي لا تعد ضرورية لعملية تفكك الوسيط لتداخل الحمض النووي الريبي (RNAi)

في الواقع تداخل الأحماض النووية الريبية (RNAi) فد تكون أكثر فعالية من ناقل الشفرة الوراثية (mRNA)الذي لا ينتقل . ولقد تم اكتشاف أنّ البروتينات الأرجونتية _العناصر المحفزة للحمضوالنووي الريبي المسكن (RISC) ، موجهة محلياً لمناطق معينة في هيولي الخلية والتي تعهد بـأجسام P أوأجسام هيولي الخلية والتي تعتبر من مناطق تفكيك RNAi بمستويات عالية.

الإسكات النسخي

The enzyme dicer trims double stranded RNA, to form small interfering RNA or microRNA. These processed RNAs are incorporated into the RNA-induced silencing complex (RISC), which targets messenger RNA to prevent translation.[37]

تستخدم مركبات تداخل RNA في الكثير من الخلايا حقيقية النواة للحفاظ على تنظيم وهجريب الجينوم الخاص بها. يساعد تعديل الهستونات وحث تشكيل الهتروكروماتين في التقليل من الجينات قبل عملية النسخ؛ يُشار إلى هذه العملية بالإسكات النسخي RITS وتتم من خلال مجموعة معقدة من البروتينات التي تتكون في انشطار الخميرة من الأرجونات التي تتكون من بروتين يسمى Chp1 وآخر يسمى Tas3؛ البروتين مجهول الوظائف. ونتيجة لذلك فإن تتطلب عملية الحث أرجونات وبروتينات RdRP. في الواقع، حذف هذه الجينات في انشطار الخميرة يعطل مثيلة الهيستون ويشكل السنترومير، مما يتسبب في تباطؤ أوتوقف طور الصعود أثناء إنقسام الخلية. في بعض الحالات، لوحظ في عمليات مماثلة مرتبطة بتعديل الهيستونات زيادة عدد الجينات عن طريق النسخ. الآلية التي يحث بها البروتين RITS الهتروكروماتين على التشكيل والتزاوج ليست مفهومة بشكل جيد. ركزت معظم الدراسات على التزاوج من نوع انشطار الخميرة، التي قد لا تكون ممثلة للأنشطة الجينية في الكائنات الأخرى. للحفاظ على تواجد الهتروكروماتين يُشكل البروتين RITS عقدة مع مكملة (siRNAscomplementary) الجينات المحلية والهستونات. يعتمد تشكيل الهتروكروماتين على المقامر وذلك قد يحدث لكونه مطلوباً لتوليد التكملة الأولى siRNAs التي هي النسخ الهدف لاحقا.

التداخل مع تحرير الحمض النووي الربيبي (RNA)

نوع تحرير الحمض النووي الريبي (RNA) هوالأكثر انتشاراً في الكائنات حقيقة النواة السائدة التي تحول نيوكليوتيد الأدينوسين إلى إينوسين في الحمض النووي الربيبي المزدوج (dsRNA) وذلك عن طريق إنزيم "نازعة أمين الأدينوسين"(ADAR) والذي تم اقتراحه أول مرة في عام ٢٠٠٠م بأن تداخل الحمض النووي الريبي RNAi) ) وتحرير مسارات الحمض النووي الريبي (A→I RNA) قد يتزاحما على سطح الحمض النووي الريبي المزدوج (dsRNA) _ السطح الذي ينموعليه كائن حي أويتصل به _ . وبالعمل تخضع بعض بدايات الأحماض النووية الريبية الصغيرة (miRNAs) لتحرير الحمض النووي الريبي (RNA) وهذه المكيانيكية قد تنظم تسلسل وتعبير الأحماض النووية الصغيرة miRNA)) الناضجة وعلاوة على ذلك، فإن واحداً على الأقل من إنزيم "نازعة أمين الأدينوسين " (ADAR) الخاص بالثدييات يمكنه عزل الأحماض النووية صغيرة التداخل ((siRNA من مسار عناصر تداخل الأحماض النووية الريبية (RNAi) ؛ ويصدر المزيد من الدعم لهذه النماذج من الدراسات التي أجريت على إنزيم نازعة أمين الأدينوسين الصفرية _ أي التي بلا قيمة _ على سلاسلات الديدان الخيطية وتشير إلى حتى تحرير الحمض النووي الريبي (A→I RNA) قد يتفاعل عكسيا مع تداخل الحمض النووي الريبي لإخماد الطفرات باطنية النمووالطفرات المتنقلة

التباين بين الكائنات الحية

Illustration of the major differences between plant and animal gene silencing. Natively expressed microRNA or exogenous small interfering RNA is processed by dicer and integrated into the RISC complex, which mediates gene silencing.[53]

الكائنات تختلف في قدرتها على تناول الحمض النووي الرايبوزي المزدوج الجديلة dsRNA واستخدامها في مسار الحمض النووي الرايبوزي المتداخل RNAi. تأثير الحمض النووي الرايبوزي المتداخل يمكن حتىقد يكون نظامي أووراثي في النباتات ودودة الربداء الرشيقة C. elegans وليس في ذبابة الفاكهة أوالثدييات. في النباتات يُعتقد حتى الحمض النووي الرايبوزي المتداخل ينتشر عن طريق انتنطق الحمض النووي الرايبوزي المتداخل الصغيرsiRNA بين الخلايا من خلال الرابطة الهيولية (قنوات في جدران الخلايا التي تمكِّن التواصل والنقل). ويأتي التوريث من مثيلة من المحفزات المستهدفة من قبل RNAi؛ يتم نسخ النمط الجديد من الحامض في جميع جيل حديث من الخلية.

هناك تمييز واسع النطاق بين النباتات والحيوانات في انتاج الحمض النووي الرايبوزي الصغير miRNA. ففي النباتات الحمض النووي الرايبوزي الصغيرقد يكون عادة مكمل بشكل مثالي أوشبه مثالي للجين الهدف ويحث على إنتاج الحمض الرايبوزي الناقل mRNA وينشق ب RISC . بينما في الحيوانات الحمض الرايبوزي الصغير miRNA مختلف في الهجريب ويؤدي إلى إحباط الإسنتساخ. بينما الـ miRNAs الخاصة بالحيوانات تميل لتكون أكثر تبايناً في التسلسل. يمكن حتى تنتج تفاعلات تحول دون البدء من عوامل الترجمة للـ RNA الرسول..

بعض البروتوزوا وحيدة الخلية مثل الليشمينيا الكبيرة " leishmania major" وتريبانوسوما كروزي "Trypanosoma cruzi " تفتقد إلى مسار تداخل الحمض الريبي النووي - التداخل الرناوي RNAi. جميع أواغلب المكونات مفقودة في بعض أنواع الفطريات وأوضح مثال لذلك فطريات الخميرة" saccharomyces cerevisiae". بالرغم من ذلك، دراسه حديثة أوضحت وجود التداخل الرناوي في فصائل اخرى من الفطريات كال ساكرومايسيس كاتالي saccharomyces caatellii وكانديدا البيكانز candida albicans .

دلالات اخرى تشير إلى وجود نوعان من البروتينات المتعلقة بالتداخل الرناوي في S. castellii والتي تسهل هذا التداخل في فطريات الخميرة S. cerevisiae. وهذا يشير على حتى بعض الفطريات الكيسية والنادىمية تفتقد إلى هذا التداخل وبالتالي البروتينات الضرورية لعملية تقطيع حمض الـ ار ان آي"RNA silencing" تكون قد فقدت بشكل تام في الكثير من سلالات الفطريات وغالبا ذلك يعود إلى تطور طرق غير مألوفة بوظائف مماثلة أوفقدان بعض المميزات الاختيارية في جدران الخميرة.

الأجهزة المرتبطة بالكائنات وحيدة الخلايا

عملية التعبير الجيني"Gene expression"

في الكائنات متعدده الخلايا تتآثر بنظام يعتمد على RNA مشابها نوعا ما لنظام التداخل الرناويRNAi.

شفرات الحمض الريبي النووي الجينية"RNA-encoding gene" تقوم بالتحكم بالحمض الريبي النووي المراسلRNAm بترجمة تلك الجينات بواسطة تكوين مكمَل للحمض الريبي النووي ثم ينفصل عنه ليكون الحمض الريبي النووي المراسلRNAm. وعلى الرغم من جميع هذه المنظمات الرناوية إلا أنها لا تعتبر مماثلة لـ miRNA بسبب عدم وجود أنزيم "dicer"دايسر . وقد اقتُرِح حتى تداخل كريسبر "CRISPR interference "في الكائنات متعددة الخلايا متماثل للموجود في نظام التداخل الرناوي في وحيدات الخلية بالرغم من أنه لا يوجد أي تشابه في هجريب البروتينات للحمض الريبي النووي.

الوظايف الحيوية

المناعة

التداخل الرناوي يعتبر جزء مهم وحيوي في الدفاع المناعي ضد الفيروسات أوأي مواد جينيه لأجسام غريبة، خصوصا في النباتات حيث أنها قد تمنع الانتشار الذاتي للينقولات. النباتات مثل Adabidopsis thaliana ("أرابيدوبسيس ثاليانا) المطلق عليه إذن الفأر" تقوم بتمثيل الكثير من التنادد _أي تشابه بين عضيات بسبب انحدارهم من جد مشهجر_ أوالصفات المتشابهة المختصة بالتفاعل بطريقة مختلفة عندما يتعرض النبات لأنواع عديدة من الڤيروسات. مع الفهم أنه حتى قبل فهم التداخل الرناوي بشكل واضح، كان معروفا حتى عملية إلغاء تنشيط الجين (gene silencing) في النباتات قد تنتشر في النبته ذاتها على هيئة التأثير الكلي؟!!

وبالتالي قد تنتقل من الأصل إلى السلالة المطعمة ( النبته الاساس للنبات الجديد ) بواسطة عملية تطعيم النباتات. منذ حتى اكتشفت هذه الصفة وعهدت كأحد وسائل الجهاز المناعي المكتسب، سمحت للنبات بأن يستجيب للفايروس بعد اللقاءة الأولية. في عملية الاستجابة، الكثير من فيروسات النباتات قامت بتطوير وسائلها لتثبيط استجاب التداخل الرناوي؛ وهذا يتضمن بروتينات الفايروس التي تربط بتر الحمض النووي الرايبوزي المزدوج بالفردي siRNA كالتي تتكون بواسطة نشاط انزيم ديسر ( dicer) بعض جينات النباتات تقوم بتمثيل أوتعريض siRNA من أجل الاستجابة طالما وجود إلتهابات بسبب أنواع محددة من البكتيريا، هذا التآثير قد يحدث نوعا من الاستجابة الكلية لمسبب السقم الذي يعمل على إخلال تنظيم أي عملية حيوية في النبات والذي يساعد في عملية الاصابة أوالالتهاب.

بالرغم من حتى الحيوانات بشكل عام تتعرض لانزيم Dicer (إنزيم مفتت) أقل من النباتات إلا حتى التداخل الرناوي في بعض الحيوانات أظهر بعض الاستجابة لمضادات الفيروسات . في كلا نوعا ذبابة الفاكهة ( البالغ والصغير)،أظهر التداخل الرناوي أهميته في المناعة الاساسية ضد الفيروسات وتتنشط ضد أي مسبب سقمي ك Drosophila X virus. نفس دور المناعة موجود أيضا في ايليجانس (C. )elegans كبروتين ارجونايتي (argonaute) الذي يتنظم حين الاستجابة إلى الفيروسات والديدان اللذان يعملان على زيادة تمثيل التداخل الرناوي وبالتالي تقاوم الإلتهاب الفايروسي.

دور التداخل الرناوي في الجهاز المناعي الأساسي للثدييات غير مفهوم كليا بعد، وذلك قد يعود إلى كمية المعلومات الضئيلة المتوفرة، وعلى الرغم من ذلك وجود فيروسات قادرة على تثبيط استجابة عملية التداخل الرناوي قد يحدث دلالة على حتى التداخل الرناوي يعتمد على الجهاز المناعي في الثدييات ولكن هذه النظرية قد تبطل نظرا لضعف الأدلة والبراهين.

هناك أيضا وظائف أخرى بديلة للتداخل الرناوي في الثدييات، علي سبيل المثال هذا التداخل قد ظهر بواسطة فايروس الهربس الذي يعمل كمحفز للكروماتين المغاير الذي يؤدي إلى تعديل الفيروس الكامن

قله (ضعف) عمل الجينات

التطور الطبيعي (المقصود به النمووالتكون) بقوم ب"تنشيط عمل" مايكروالحمض الرايبي النوووي وهذا يتضمن كلا من الانترون و" المناطق الفاصله بين جميع جين". التطور يلعب دور مهم في كبح ترجمة الجين and in the regulation of. وفي تنظيم النموخصوصا في وقت التخلق والحفاظ على الخلايا الغير متمايزة اوالمتباينة بشكل غير تام كالخلايا الجذعيه. هذه العملية تم تعريفها لاول مره في عام ١٩٩٣ في c.elegans.

وتم اكتشافها أيضاً في النبات، في نبته تدعى ارابيدوبسيس عندما عثر ان JAW microRNA" يدخل في تنظيم عدد من الجينات المسئوله عن تحديد شكل النبته. في النباتات ، اغلب الجينات التي تنظم بواسطه مايكروحمض الرايبوالنووي تعتبر من عوامل عملية النسخ. وبالتالي نشاط هذا الحمض يعتبر واسع حيث يمتد لكل شبكات للجين خلال فتره النموبواسطة إحداث تعديلات لأهم الجينات المنظمة. وهذا يتضمن عوامل النسخ وبروتينات F-box.

في اغلب الكائنات (وهذا يتضمن الإنسان)، ارتبط مفهوم مايكروحمض الرايبوالنووي بتكوين الأورام وعدم انتظام دورة حياة الخلية. في هذه الحالة يعمل الحمض كجين ورمي وجين مثبط للورم.

عملية التطور

بناءً على التحليل القائم على التبسيط (parsimony-based) في فهم الوراثة العرقي -دراسة العلاقات التطورية بين مجموعات الكائنات الحية، التي تُكتشف عبرَ التحاليل الجزيئية ودراسة تشكيل الكائنات المتنوعة-، عثر حتى أغلب المورثات في حقيقيات النوى (Eukaryote‏) على الأرجح تمر في مسار تداخل الحمض النووي الريبي المبكر، كما اعتُقد حتى عدم وجود هذا المسار في حقيقيات نوى معينة يعتبر صفة. إذا هذا النظام الموروث غالباً يحتوي بروتين واحد على الأقل شبيه بالدايسر وواحد من جميع من بروتين أرجونات argonaute وبروتين PIWI بالإضافة إلى الرنا المعتمد على بوليميراز الرنا، ويشار إلى حتى هذه البروتينات من الممكن حتىقد يكون لها مهمات أخرى في الخلية. وفي مجال أوسع فإن إحدى دراسات فهم الجينوم المقارن أشارت أيضاً إلى حتى حقيقيات النوى التابعة للمجموعة التاجية قد مرت بكل المراحل السابقة وبالتالي فقد يحدث لها ارتباط بطريقة ما بأنظمة تحطيم الحمض الرايبوزي كما في exosom. هذه الدراسة اقترحت أيضاً حتى عائله بروتين أرجونات argonaute والتي يتشارك فيها جميع الكائنات حقيقيات النوى وأغلب العتائق (الجراثيم العتيقة Archaea) وبعض البكتيريا مثل أكويفكس إيوليكوس (Aquifex aeolicus) قد تكون مماثلة ومنشأة بالأصل من مكونات الفترة الأولى في نظام الترجمة (translation initiation system).

على وجه العموم فقد اتفق على حتى دور المورّثات في نظام تداخل الرنا يكمن في أنها خط الدفاع المناعي الأول ضد الأجزاء الجينية الخارجية الغريبة عنه كالترانسبوزونات وفيروسات الجينوم. من الممكن كانت الأدوار المرتبطة بذلك مثل تعديل هيستون قد لوحظت في مورثات حقيقيات النوى الحديثة، وإن كانت الأدوار الأخرى المرتبطة كضبط عملية النموبواسطة مايكروالحمض الرايبوزي miRNA استنبطت في وقتٍ لاحق.

إن جينات RNAi (كمكونات للجهاز المناعي الأساسي ضد الفيروسات في الكثير من كائنات حقيقيات النوى) يدخل في عملية سباق التسلح التطوري مع الجين الفيروسي. بعض الفيروسات كوّنت آليات محددة من أجل تثبيط الاستجابة لعملية تداخل الرنا RNAi في خلايا الجسم المُضيف، وهذا ماتم ملاحظته في فيروسات النبات على وجه الخصوص. دراسات اخرى عن مستوى التطور في ذبابة الفاكهة (Drosophila) أوضحت ان الجينات في مسار RNAi تخضع لانتقاء اتجاهي قوي وهي أسرع الجينات تطوراً في جينوم هذا الكائن.

التطبيقات التقنية

يستخدم نظام تدخل RNA عادة في فهم الأحياء التجريبي لدراسة وظائف الجينات في مغرسة الخلية والكائنات الحية المثالية. الحمض الثنائي الشريطي RNA مركب من سلسلة مكملة لجين نافع ويدخل في الخلية او الكائن الحي، حيث يتم التعهد عليه كجين وراثي خارجي ينشط مسار تدخل RNA. وقد توصل الباحثون إلى ان استخدام هذه الالية يُسبب نقصاً حاداً في مقدار الجين المستهدف, ويمكن دراسة تاثيرات هذا النقصان ان يظهر الدور الفسيولوجي لمنتج الجين.وقد لا يلغي حمض RNAi الرنوي التعبير عن الجينات تماما, ويُطلق على هذه التقنية أحيانا مُسمى "الضربة" لتمييزها عن إجراءات "الضربة القاضية" التي يتم من خلالها التخلص من الجين تماما.

وُجهت الجهود في فهم الأحياء الحسابي نحوتصميم كاشفات dsRNA المزدوجة الناجحة التي تزيد من الضربات الجينية حتى الكاشف مع التقليل من التأثيرات الخارجية. تنشأ التأثيرات الخارجية البعيدة عن الهدف عندماقد يكون لدى إنتاج الحمض النووي الريبي قاعدة لترتيب المكونات في شيء مبلور _خاصة ترتيب النيوكوتيد في الأحماض النووية _وتقترن وبالتالي تخفض مقدار الجينات المتعددة في جميع مرة. تحدث هذه المشاكل بشكل أكثر عندما يحتوي dsRNA المزدوج الجديلة على تسلسلات متكررة . وقد تشير الدراسات إلى حتى جينات H . sapiens, C. elegans, and S. إلى احتمال احتواء 10% من siRNAs على آثار جوهرية خارج نطاق الهدف. وقد طورت أدوات برمجيات التصميم العام لتطبيق الخوارزميات, على حيوانات ثديه خاصة, وفيروسات خاصة. ويتم التحقق تلقائياً من siRNAs لاحتمال حدوث تفاعلات معاكسة.

فهم الجينوم الوظيفي

A normal adult Drosophila fly, a common model organism used in RNAi experiments.

استخدمت معظم تطبيقات فهم الجينوم الوظيفي RNA في الحيوانات C. elegans الربداء الأنيقة (أحد انواع الديدان الاسطوانية) وDrosophila, ذبابة الفاكهة، باعتبارهما النموذح الحي المنتشر الذي يمتاز بأن تداخل RNA فيه هوالأكثر فعالية. الربداء الأنيقة مفيدة بشكل خاص في أبحاث تداخل RNA وذلك لسببين؛ الأول لأن تأثيرات اطفاء الجينات تنتقل عادة بالوراثة والثاني لأن عملية تسليم الرنا ذي النطاقين تكون سهلة جداً. من خلال آلية غير مفهومة التفاصيل فإن بكتيريا مثل "البكتيريا الإشريكية القولونية" التي تحمل RNA ذي النطاقين المطلوب يتم تقديمها كغذاء للديدان ومن خلالها ستنتقل حمولتها من RNA إلى الدودة عن طريق السبيل المعوي. تُعد طريقة "التسليم بالتغذية" مماثلة في كفاءتها من حيث اطفاء الجينات المحرضة لطرق نقل أخرى أكثر تكلفة والتي تستغرق وقتاً طويلاً، ومثال على تلك الطرق نقع الديدان في محلول RNA ذي نطاقين وحقن RNA ذي النطاقين في الغدد التناسلية. على الرغم من حتى التسليم أكثر صعوبة في باقي الكائنات الحية إلا حتى الجهود المبذولة تتولّى تطبيقات الفرز الجينومي في المغرسة الخلوية لخلايا الثدييات على نطاق واسع.

يتطلب اقتراب التوصل لتصميم مخطات (المقصود بمخطات الجينوم، تقطيع الجينوم إلى أجزاء تم تحميلها على فيروس أوبلازميد أوكروموسوم اصطناعى للخميرة حتى يمكن اللجوء إلى أى منها عند القيام بالأبحاث) نطاق جينوم تداخل RNA تطور فهمي وتكنولوجي أكثر مما يتطلبه تصميم RNA متداخل صغير مفرد وذلك بسبب مجموعة محددة من ظروف التجربة اللازمة لكل تصميم. يتم عادة استخدام شبكات عصبونية اصطناعية لأغراض تصميم مخطات RNA متداخل صغير ولغرض تسقط الكفاءة المحتملة عند سقوط الجين وانتهاؤه. كما ينظر إلى الفرز الجينومي الكامل كطريقة واعدة مبشرة للمشروع الجينومي (تفسير السلسلة الجينومية) ولقد أثارت هذه الطريقة طرق فرز أخرى لتتطور وتحقق انتاجية عالية باستخدام المجموعات الصغيرة. غير أنه تم طرح عدة تساؤلات حول الفائدة من هذه الآليات المستخدمة بالفرز وحول قابلية التقنية للتطور والتطبيق على نموذج حي لتعميمها على كائنات متقاربة وذات صلة. مثل تعميم نموذج الربداء الأنيقة لما هوقريب منها من الديدان الخيطية الطفيلية.

يُعد فهم الجينوم الوظيفي الذي يـستخدم تداخل RNA تقنية خاصة وجذابة في النباتات من نواحي الرسم التفصيلي الجينومي وفي التفسير، وذلك لأن كثير من النباتات تكون متعددة الصيغ الصبغية مما يشكل تحدي جوهري للطرق الجينية الهندسية التقليدية، مثال ذلك: نجح استخدام تداخل RNA في دراسات فهم الجينوم الوظيفي على قمح الخبز (سداسي الصيغة الصبغية) بالإضافة إلى أكثر النماذج النباتية المنتشرة مثل نبتة كشف الألغام ونبات الذرة.

التطبيقات العلاجية

An adult C. elegans worm, grown under RNAi suppression of a nuclear hormone receptor involved in desaturase regulation. These worms have abnormal fatty acid metabolism but are viable and fertile.[113]

العدوى الڤيروسية

قد يحدث من الممكن استخدام مثبط تداخل الرنا في العلاج. على الرغم من صعوبة ادخال شريط طويل من الرنا المزدوج "dsRNA" إلى خلايا الثدييات حيث تتعارض مع تأثير المضادات، إلا حتى استعمال مثبط RNA القصير "short interfering RNA" كان اكثر نجاحا. وقد كان من ضمن التطبيقات الأولى للتجارب السريرية تلك التي استخدمت لعلاج التنكس البقعي والفَيْروسُ المِخْلَوِيُّ التَّنَفُّسِيّ] كما أثبت مثبط RNAi فعاليته في عكس فشكل الكبد في التجارب السريرية التي أجريت على الفئران. ومن الإستخدامات السريرية الأخرى المُقترحة كمضاد للفيروسات، يتضمن استعمال تداخل الرنا بشكل موضعي لحالات الإلتهابات (في جامعة هارفرد، التجارب التي طُبقت على الفئران حتى الآن على فيروس الحلأ البسيط النوع 2 وتثبيط التعبير الجيني لفيروس الخلايا السرطانية، بالإضافة إلى أنه قضى تماماً على المستقبلات والمستقبلات المشاركة المضيفة لفيروس نقص المناعة المكتسبة HIV، تثبيط فيروس التهاب الكبد الوبائي أ وفيروس التهاب الكبد الوبائي ب, والتعبير الجيني للانفلونزا وتثبيط عملية تكاثر فيروس الحصبة وقد تم اقتراحه من ضمن العلاجات المُحتملة للأمراض التنكسية العصبية، مع اهتمام خاص بأمراض عديد الغلوتامين كسقم هانتنجتون

السرطان

كما ينظر إلى تدخل الحمض النووي الريبي باعتباره طريقة واعدة لعلاج السرطان عن طريق إيقاف الجينات المتنوعة في عملية زيادة الإستجابة على التحفيز في الخلايا السرطانية أوالجينات المسؤولة عن انقسام الخلايا. اظهرت البحوث الأساسية في مجال استخدام تدخل الحمض النووي الريبي (RNAi) خلال الإختبارات السريرية له تطوير في كيفية التوليد الآمنة، والتي حتى الآن ضمت أنظمة النواقل الفيروسية المشابهة لتلك التي تم اقتراحها للعلاج بالجينات.

يتم توظيف الوسائل القائمة على الدهون عادة بسبب مخاوف تتعلق بالسلامة مع وسائل النواقل الفيروسية، والغير الفيروسية والنواقل البوليمرية أيضا من الوسائل المرشحة الواعدة. اوضحت دراسات الموروث القاضية من قبل بارتليت وديفيز في النمذجة الحاسوبية لتدخل الحمض النووي الريبي الصغير (RNAi) الغير فيروسي بالتجارب المختبرية السلوك الزماني لتدخل الحمض النووي الريبي الصغير في هذه الأنظمة. فاستخدموا نموذجهم دخال جرعات علاجية لإدخال الحمض النووي الريبي الصغير (RNAi)، كانوا قادرين حسابياً وتجريبياً على إظهار حتى المدة القاضية كانت تعتمد بشكل رئيسي على مضاعفة الوقت من الخلايا التي سلمها التدخل الحمض النووي الريبي الصغير، بينما تعتمد الذروة القاضية على جرعة تسليمها في المقام الأول. يفترض أن تكون الاعتبارات الحركية لإدخال الحمض النووي الريبي الصغير (RNAi) حتمية للتخطيط الآمن وجداول الجرعات الفعالة كأساليب غير فيروسية على حمل تدخل الحمض النووي الريبي الصغير (RNAi)على مواصلة التطوير.

على الرغم من كثرة الدراسات الواعدة لزراعة الخلايا بواسطة مثبط "تداخل الرنا"، فهناك تساؤلات عن مدى سلامة استخدامه، خاصة من احتمال حدوث آثار غير مرغوبة "off-target" كالتأثيرعلى جين ذوتسلسل مشابه للجين المستهدف مصادفة للذي تم قمعه أيضاً. قدرت احدى الدراسات الحسابية لفهم الجينات ان معدل الخطأ للتفاعل الجيني غير المستهدف "off-target" يصل إلى ما يقارب ١٠٪. وقد ذكرت احدى الدراسات الكبرى التي أُجريت على الفئران المصابة بسقم كبدي ان ٢٣ فأراً من ٤٩ ممن تم استخدام مثبط "RNAi" لعلاجهم حسب الأنظمة المُتبعة أدت إلى وفاتهم. وقد افترض الباحثون ان هذه النسبة الكبيرة المُثيرة للقلق هي سبب زيادة التشبع في مسار dsRNA المزدوج،, ناتجاً عن استخدام shRNAs مما قلل الهيبارين الذي يجب معالجته في النواة ونقله إلى السيتوبلازم بطريقة فعالة. وكل ما تجاوز ما هي إلا نظريات ما زالت قيد الدراسة, وبهدف الحدّ من الأثار الجانبية في تطبيقات RNAiالعلاجية المحتملة, يتم حالياً تطوير تطبيقات علاج RNA واستخدامه لإستهداف فيروس نقص المناعة المكتسبة, وفيروسات أخرى كفيروس نقص المناعة المكتسبة "HIV-1 " التي تُعد أهدافاً صعبة على وجه التحديد بالنسبة لهجوم RNAiحيث يسهل عليها الهروب,مما يحتاج استخدام استراتيجيات دمج RNAi لتجنب هروب الفيروس. يُعد استعمال " RNAi" كمضاد للفيروسات واعد جداً, لكنه يبقى ذوأهمية حاسمة لتضم الكثير من الضوابط في فحوصات الإختبارات ما قبل السريرية التي تظهر بشكل قاطع التسلسل المحدد لعمل محفزات RNAi المثبط..

نمت الفهم بشكل كبير منذ اكتشاف تداخل الرنا وعلى الرغم من أنه مفيد جداً، إلا ان تداخل الرنا يصل للأنسجة مما يبرهن انها تشكل تحدياً فهمياً مستعصياً وخاصة في الأنسجة العميقة داخل الجسم ويكون وصول RNAi للانسجة السطحية مثل العين والجهاز التنفسي سهلاً.

يستخدم siRNA في هذه الحالات للاتصال المباشر مع الانسجة بهدف النقل .وتداخل RNA الناتجقد يكون ناجحاً للغاية في الهجريز على الجينات المستهدفة . يجب اتخاذ التدابير اللازمة عند وصول siRNA لطبقات الانسجة العميقة داخل الجسم لحماية siRNA من nucleases , لكن استهداف مناطق معينة يشكل عقبة رئيسية. بالرغم من ذلك تحارب الجرعات العالية من siRNA ضمان الوصول للانسجة ,وهذه الصعوبة في مثل هذه الحالات hepatotoxicity was reported.

الأمراض العصبية

الصعوبات في التطبيقات العلاجية

آفاق التطبيقات العلاجية

الدواء	الهدف	Delivery System	السقم	الفترة	الحالة	الشركة	المعهد
ALN–VSP02	KSP and VEGF	LNP	الأورام الصلبة	I	اكتمل	Alnylam Pharmaceuticals	NCT01158079
siRNA–EphA2–DOPC	EphA2	LNP	السرطانات المتقدمة	I	Recruiting	مركز إم دي أندرسون للسرطان	NCT01591356
Atu027	PKN3	LNP	الأورام الصلبة	I	اكتمل	Silence Therapeutics	NCT00938574
TKM–080301	PLK1	LNP	السرطان	I	Recruiting	Tekmira Pharmaceutical	NCT01262235
TKM–100201	VP24, VP35, Zaire Ebola L-polymerase	LNP	عدوى إبولا-الڤيروسية	I	Recruiting	Tekmira Pharmaceutical	NCT01518881
ALN–RSV01	RSV nucleocapsid	Naked siRNA	عدوى الڤيروس التنفسي المخلوي البشري	II	اكتمل	Alnylam Pharmaceuticals	NCT00658086
PRO-040201	ApoB	LNP	Hypercholesterolaemia	I	أوقف	Tekmira Pharmaceutical	NCT00927459
ALN–PCS02	PCSK9	LNP	Hypercholesterolaemia	I	اكتمل	Alnylam Pharmaceuticals	NCT01437059
ALN–TTR02	TTR	LNP	Transthyretin-mediated amyloidosis	II	Recruiting	Alnylam Pharmaceuticals	NCT01617967
CALAA-01	RRM2	Cyclodextrin NP	الأورام الصلبة	I	نشط	Calando Pharmaceuticals	NCT00689065
TD101	K6a (N171K mutation)	Naked siRNA	Pachyonychia congenita	I	اكتمل	Pachyonychia Congenita Project	NCT00716014
AGN211745	VEGFR1	Naked siRNA	Age-related macular degeneration, choroidal neovascularization	II	أوقف	Allergan	NCT00395057
QPI-1007	CASP2	Naked siRNA	Optic atrophy, non-arteritic anterior ischaemic optic neuropathy	I	اكتمل	Quark Pharmaceuticals	NCT01064505
I5NP	p53	Naked siRNA	إصابات الكلى، الفشل الكلوي الحاد	I	اكتمل	Quark Pharmaceuticals	NCT00554359
			Delayed graft function، مضاعفات غرس الكلى	I, II	Recruiting	Quark Pharmaceuticals	NCT00802347
PF-655 (PF-04523655)	RTP801 (Proprietary target)	Naked siRNA	Choroidal neovascularization, diabetic retinopathy, diabetic macular oedema	II	نشط	Quark Pharmaceuticals	NCT01445899
siG12D LODER	KRAS	LODER polymer	سرطان البنكرياس	II	Recruiting	Silenseed	NCT01676259
Bevasiranib	VEGF	Naked siRNA	الاستسقاء البقعي السكري، الضمور البقعي	II	اكتمل	Opko Health	NCT00306904
SYL1001	TRPV1	Naked siRNA	آلام العين، متلازمة العين الجافة	I, II	Recruiting	Sylentis	NCT01776658
SYL040012	ADRB2	Naked siRNA	ارتفاع ضغط قاع العين، المياه الزرقاء مفتوحة الزاوية	II	Recruiting	Sylentis	NCT01739244
CEQ508	CTNNB1	Escherichia coli-carrying shRNA	Familial adenomatous polyposis	I, II	Recruiting	Marina Biotech	Unknown
RXi-109	CTGF	Self-delivering RNAi compound	Cicatrix scar prevention	I	Recruiting	RXi Pharmaceuticals	NCT01780077
ALN–TTRsc	TTR	siRNA–GalNAc conjugate	Transthyretin-mediated amyloidosis	I	Recruiting	Alnylam Pharmaceuticals	NCT01814839
ARC-520	Conserved regions of HBV	DPC	HBV	I	Recruiting	Arrowhead Research	NCT01872065

التكنولوجيا الحيوية

تم استخدام تداخل RNA في عدة تطبيقات من التقنية الحيوية وخاصة في هندسة الأغذية النباتية التي تنتج مستويات قليلة من السموم النباتية الطبيعية. تستغل مثل هذه التقنيات النمط الظاهري للتداخل الرني الثابت والموروث في مخزون النبتة، عملى سبيل المثال تعتبر بذور القطن غنية بالبروتين الغذائي ولكنها تحتوي بشكل طبيعي على سم التيربينويد الذي يُنتج الجوسيبول مما يجعلها غير مناسبة للاستهلاك البشري. تم استخدام التداخل الرني لانتاج مخزون القطن الذي تحتوي بذوره على مستويات منخفضة من delta-cadinene synthase وهوالإنزيم الأساسي لإنتاج الجوسيبول دون حتى يؤثر على انتاج الإنزيم في أجزاء أخرى من النبتة، فهماً بأن للجوسيبول دوراً هاماً في الحد من تضرر النبتة من التلف. كذلك توجهت جهود مشابه للتقليل من انتاج الينامارين الطبيعي والمنتج لسيانيد الهيدروجين في نبتة الكسافا.

بالرغم من عدم اجتياز المنتجات النباتية التي تعتمد على التداخل الرني في الهندسة الجينية فترة التجارب بعد، إلا حتى جهود التطوير خفضت مستويات المواد المُسببة للحساسية في نبات الطماطم بنجاح كما خفضت احتمال ظهور مواد سرطانية في نبات التبغ، كما تم هندسة صفات أخرى للنباتات في المعمل ومن ضمن تلك الصفات إنتاج منتجات طبيعية غير مخدرة من نبتة الخشخاش المنوم ومقاومة فيروسات النباتات الشائعة وتحصين النباتات مثل الطماطم بمضادات الأكسدة الغذائية. وُضعت المنتجات التجارية السابقة مثل طماطم Flavr Savr وصنفين من البابايا المقاومة لفيروس ringspot الذي يصيب البابايا باستخدام تقنية مضادة ولكن من الأرجح أنها استغلت نهج التداخل الرني.

فحص RNAi بمقياس جينوم

تعتمد أبحاث فحص RNAi على مقياس الجينوم في تقنية فحص سرعة المعالجة العالية وتتيح تقنية RNAi HTS لفحص الجينومwide loss-of-function screening وهي تستخدم على نطاق واسع للتعهد على الجينات المرتبطة بأنماط حيوية ظاهرية وقد سُميت هذه التقنية بالموجة الجينومية الثانية التي تلت الموجة الجينومية الأولى لتعبيرالإصطفاف الجيني المجهري microarray واكتشاف أشكال النيوكليدات الأُحادية. وأحد أعظم مزايا فحص RNAi بمقياس الجينوم هي التسارع الكبير في انتاجية المعلومات مع القدرة على إنتاج قدرٍ كبير من المعلومات في جميع تجربة، فقد أدى فحص RNAi بمقياس الجينوم إلى ثورة في كمية المعلومات الناتجة وبناء عليه فقد كانت أحد الصعوبات الأساسية في أبحاث RNAi بمقياس الجينوم هي تقاط أبرز المعلومات الحيوية من بين ذلك الكم الضخم من المعلومات المُنتجة مما يستدعي استخدام وسائل احصائية معلوماتية حيوية كتلك الواردة في الكتاب الذي تم نشره مؤخراً لتحليل فحوصات RNAi وتضم العملية الأساسية لفحص RNAi المعتمدة على الخلايا: (1) اختيار مخطة RNAi المناسبة، (2) اختيار نوع صامد ومستقر من الخلايا، (3) عملية نعد الخلايا المختارة باستخدام عناصر RNAi من مخطة RNAi المختارة، (4) العلاج اللازم أوفترة الحضانة، (5) التقاط الإشارات، (6) تحليل الإحصاءات والبيانات الحيوية، (7) تحديد الجينات الهامة أوالأهداف العلاجية.

المراجع

^ Daneholt, Bertil. "Advanced Information: RNA interference". The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2006. Archived from the original on 2007-01-20. Retrieved 2007-01-25.
^ Bagasra O, Prilliman KR (2004). "RNA interference: the molecular immune system" (PDF). J. Mol. Histol. 35 (6): 545–53. doi:10.1007/s10735-004-2192-8. PMID 15614608.
^ Bernstein E, Caudy A, Hammond S, Hannon G (2001). "Role for a bidentate ribonuclease in the initiation step of RNA interference". Nature. 409 (6818): 363–6. doi:10.1038/35053110. PMID 11201747.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Siomi, Haruhiko; Siomi, Mikiko C. (22 January 2009). "On the road to reading the RNA-interference code". Nature. 457 (7228): 396–404. Bibcode:2009Natur.457..396S. doi:10.1038/nature07754. PMID 19158785.
^ Zamore P, Tuschl T, Sharp P, Bartel D (2000). "RNAi: double-stranded RNA directs the ATP-dependent cleavage of mRNA at 21 to 23 nucleotide intervals". Cell. 101 (1): 25–33. doi:10.1016/S0092-8674(00)80620-0. PMID 10778853.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Vermeulen A, Behlen L, Reynolds A, Wolfson A, Marshall W, Karpilow J, Khvorova A (2005). "The contributions of dsRNA structure to Dicer specificity and efficiency". RNA. 11 (5): 674–82. doi:10.1261/rna.7272305. PMC 1370754. PMID 15811921.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Castanotto, Daniela; Rossi, John J. (22 January 2009). "The promises and pitfalls of RNA-interference-based therapeutics". Nature. 457 (7228): 426–433. Bibcode:2009Natur.457..426C. doi:10.1038/nature07758. PMC 2702667. PMID 19158789.
^ Qiu S, Adema C, Lane T (2005). "A computational study of off-target effects of RNA interference". Nucleic Acids Res. 33 (6): 1834–47. doi:10.1093/nar/gki324. PMC 1072799. PMID 15800213.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Ahlquist P (2002). "RNA-dependent RNA polymerases, viruses, and RNA silencing". Science. 296 (5571): 1270–3. Bibcode:2002Sci...296.1270A. doi:10.1126/science.1069132. PMID 12016304.
^ Parker G, Eckert D, Bass B (2006). "RDE-4 preferentially binds long dsRNA and its dimerization is necessary for cleavage of dsRNA to siRNA". RNA. 12 (5): 807–18. doi:10.1261/rna.2338706. PMC 1440910. PMID 16603715.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Liu Q, Rand T, Kalidas S, Du F, Kim H, Smith D, Wang X (2003). "R2D2, a bridge between the initiation and effector steps of the Drosophila RNAi pathway". Science. 301 (5641): 1921–5. Bibcode:2003Sci...301.1921L. doi:10.1126/science.1088710. PMID 14512631.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Baulcombe D (2007). "Molecular biology. Amplified silencing". Science. 315 (5809): 199–200. doi:10.1126/science.1138030. PMID 17218517.
^ Pak J, Fire A (2007). "Distinct populations of primary and secondary effectors during RNAi in C. elegans". Science. 315 (5809): 241–4. Bibcode:2007Sci...315..241P. doi:10.1126/science.1132839. PMID 17124291.
^ Sijen T, Steiner F, Thijssen K, Plasterk R (2007). "Secondary siRNAs result from unprimed RNA synthesis and form a distinct class". Science. 315 (5809): 244–7. Bibcode:2007Sci...315..244S. doi:10.1126/science.1136699. PMID 17158288.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Wang QL, Li ZH (2007). "The functions of microRNAs in plants". Front. Biosci. 12: 3975–82. PMID 17485351.
^ Zhao Y, Srivastava D (2007). "A developmental view of microRNA function". Trends Biochem. Sci. 32 (4): 189–97. doi:10.1016/j.tibs.2007.02.006. PMID 17350266.
^ Gregory R, Chendrimada T, Shiekhattar R (2006). "MicroRNA biogenesis: isolation and characterization of the microprocessor complex". Methods Mol Biol. 342: 33–47. doi:10.1385/1-59745-123-1:33. ISBN . PMID 16957365.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Pillai RS, Bhattacharyya SN, Filipowicz W (2007). "Repression of protein synthesis by miRNAs: how many mechanisms?". Trends Cell Biol. 17 (3): 118–26. doi:10.1016/j.tcb.2006.12.007. PMID 17197185.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Okamura K, Ishizuka A, Siomi H, Siomi M (2004). "Distinct roles for Argonaute proteins in small RNA-directed RNA cleavage pathways". Genes Dev. 18 (14): 1655–66. doi:10.1101/gad.1210204. PMC 478188. PMID 15231716.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Lee Y, Nakahara K, Pham J, Kim K, He Z, Sontheimer E, Carthew R (2004). "Distinct roles for Drosophila Dicer-1 and Dicer-2 in the siRNA/miRNA silencing pathways". Cell. 117 (1): 69–81. doi:10.1016/S0092-8674(04)00261-2. PMID 15066283.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Gregory R, Chendrimada T, Cooch N, Shiekhattar R (2005). "Human RISC couples microRNA biogenesis and posttranscriptional gene silencing". Cell. 123 (4): 631–40. doi:10.1016/j.cell.2005.10.022. PMID 16271387.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Lodish H, Berk A, Matsudaira P, Kaiser CA, Krieger M, Scott MP, Zipurksy SL, Darnell J (2004). (5th ed.). WH Freeman: New York, NY. ISBN .CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Matranga C, Tomari Y, Shin C, Bartel D, Zamore P (2005). "Passenger-strand cleavage facilitates assembly of siRNA into Ago2-containing RNAi enzyme complexes". Cell. 123 (4): 607–20. doi:10.1016/j.cell.2005.08.044. PMID 16271386.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Leuschner P, Ameres S, Kueng S, Martinez J (2006). "Cleavage of the siRNA passenger strand during RISC assembly in human cells". EMBO Rep. 7 (3): 314–20. doi:10.1038/sj.embor.7400637. PMC 1456892. PMID 16439995.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Haley, B (2004). "Kinetic analysis of the RNAi enzyme complex". Nature Structural & Molecular Biology. 11 (7): 599–606. doi:10.1038/nsmb780. Unknown parameter |coauthors= ignored (|author= suggested) (help)
^ Schwarz DS, Hutvágner G, Du T, Xu Z, Aronin N, Zamore PD (2003). "Asymmetry in the assembly of the RNAi enzyme complex". Cell. 115 (2): 199–208. doi:10.1016/S0092-8674(03)00759-1. PMID 14567917.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Preall J, He Z, Gorra J, Sontheimer E (2006). "Short interfering RNA strand selection is independent of dsRNA processing polarity during RNAi in Drosophila". Curr Biol. 16 (5): 530–5. doi:10.1016/j.cub.2006.01.061. PMID 16527750.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Tomari Y, Matranga C, Haley B, Martinez N, Zamore P (2004). "A protein sensor for siRNA asymmetry". Science. 306 (5700): 1377–80. Bibcode:2004Sci...306.1377T. doi:10.1126/science.1102755. PMID 15550672.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Ma J, Yuan Y, Meister G, Pei Y, Tuschl T, Patel D (2005). "Structural basis for 5'-end-specific recognition of guide RNA by the A. fulgidus Piwi protein". Nature. 434 (7033): 666–70. Bibcode:2005Natur.434..666M. doi:10.1038/nature03514. PMID 15800629.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Sen G, Wehrman T, Blau H (2005). "mRNA translation is not a prerequisite for small interfering RNA-mediated mRNA cleavage". Differentiation. 73 (6): 287–93. doi:10.1111/j.1432-0436.2005.00029.x. PMID 16138829.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Gu S, Rossi J (2005). "Uncoupling of RNAi from active translation in mammalian cells". RNA. 11 (1): 38–44. doi:10.1261/rna.7158605. PMC 1370689. PMID 15574516.
^ Sen G, Blau H (2005). "Argonaute 2/RISC resides in sites of mammalian mRNA decay known as cytoplasmic bodies". Nat Cell Biol. 7 (6): 633–6. doi:10.1038/ncb1265. PMID 15908945.
^ Holmquist G, Ashley T (2006). "Chromosome organization and chromatin modification: influence on genome function and evolution". Cytogenet Genome Res. 114 (2): 96–125. doi:10.1159/000093326. PMID 16825762.
^ Verdel A, Jia S, Gerber S, Sugiyama T, Gygi S, Grewal S, Moazed D (2004). "RNAi-mediated targeting of heterochromatin by the RITS complex". Science. 303 (5658): 672–6. Bibcode:2004Sci...303..672V. doi:10.1126/science.1093686. PMC 3244756. PMID 14704433.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Irvine D, Zaratiegui M, Tolia N, Goto D, Chitwood D, Vaughn M, Joshua-Tor L, Martienssen R (2006). "Argonaute slicing is required for heterochromatic silencing and spreading". Science. 313 (5790): 1134–7. Bibcode:2006Sci...313.1134I. doi:10.1126/science.1128813. PMID 16931764.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Volpe T, Kidner C, Hall I, Teng G, Grewal S, Martienssen R (2002). "Regulation of heterochromatic silencing and histone H3 lysine-9 methylation by RNAi". Science. 297 (5588): 1833–7. Bibcode:2002Sci...297.1833V. doi:10.1126/science.1074973. PMID 12193640.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Volpe T, Schramke V, Hamilton G, White S, Teng G, Martienssen R, Allshire R (2003). "RNA interference is required for normal centromere function in fission yeast". Chromosome Res. 11 (2): 137–46. doi:10.1023/A:1022815931524. PMID 12733640.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Li LC, Okino ST, Zhao H, Pookot D, Place RF, Urakami S, Enokida H, Dahiya R (2006). "Small dsRNAs induce transcriptional activation in human cells". Proc Natl Acad Sci USA. 103 (46): 17337–42. Bibcode:2006PNAS..10317337L. doi:10.1073/pnas.0607015103. PMC 1859931. PMID 17085592.CS1 maint: multiple names: authors list (link) خطأ استشهاد: وسم <ref> غير صالح؛ الاسم "Li" معهد أكثر من مرة بمحتويات مختلفة. خطأ استشهاد: وسم <ref> غير صالح؛ الاسم "Li" معهد أكثر من مرة بمحتويات مختلفة.
^ Noma K, Sugiyama T, Cam H, Verdel A, Zofall M, Jia S, Moazed D, Grewal S (2004). "RITS acts in cis to promote RNA interference-mediated transcriptional and post-transcriptional silencing". Nat Genet. 36 (11): 1174–80. doi:10.1038/ng1452. PMID 15475954.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Bass B (2002). "RNA Editing by Adenosine Deaminases That Act on RNA". Annu Rev Biochem. 71: 817–46. doi:10.1146/annurev.biochem.71.110601.135501. PMC 1823043. PMID 12045112.
^ Bass B (2000). "Double-stranded RNA as a template for gene silencing". Cell. 101 (3): 235–8. doi:10.1016/S0092-8674(02)71133-1. PMID 10847677.
^ Luciano D, Mirsky H, Vendetti N, Maas S (2004). "RNA editing of a miRNA precursor". RNA. 10 (8): 1174–7. doi:10.1261/rna.7350304. PMC 1370607. PMID 15272117.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Yang W, Chendrimada T, Wang Q, Higuchi M, Seeburg P, Shiekhattar R, Nishikura K (2006). "Modulation of microRNA processing and expression through RNA editing by ADAR deaminases". Nat Struct Mol Biol. 13 (1): 13–21. doi:10.1038/nsmb1041. PMC 2950615. PMID 16369484.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Yang W, Wang Q, Howell K, Lee J, Cho D, Murray J, Nishikura K (2005). "ADAR1 RNA Deaminase Limits Short Interfering RNA Efficacy in Mammalian Cells". J Biol Chem. 280 (5): 3946–53. doi:10.1074/jbc.M407876200. PMC 2947832. PMID 15556947.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Nishikura K (2006). "Editor meets silencer: crosstalk between RNA editing and RNA interference". Nat Rev Mol Cell Biol. 7 (12): 919–31. doi:10.1038/nrm2061. PMC 2953463. PMID 17139332.
^ Jones L, Ratcliff F, Baulcombe DC (2001). "RNA-directed transcriptional gene silencing in plants can be inherited independently of the RNA trigger and requires Met1 for maintenance". Current Biology. 11 (10): 747–757. doi:10.1016/S0960-9822(01)00226-3. PMID 11378384.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ خطأ استشهاد: وسم <ref> غير سليم؛ لا نص تم توفيره للمراجع المسماة Saumet
^ Humphreys DT, Westman BJ, Martin DI, Preiss T (2005). "MicroRNAs control translation initiation by inhibiting eukaryotic initiation factor 4E/cap and poly(A) tail function". Proc Natl Acad Sci USA. 102 (47): 16961–16966. Bibcode:2005PNAS..10216961H. doi:10.1073/pnas.0506482102. PMC 1287990. PMID 16287976.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ DaRocha W, Otsu K, Teixeira S, Donelson J (2004). "Tests of cytoplasmic RNA interference (RNAi) and construction of a tetracycline-inducible T7 promoter system in Trypanosoma cruzi". Mol Biochem Parasitol. 133 (2): 175–86. doi:10.1016/j.molbiopara.2003.10.005. PMID 14698430.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Robinson K, Beverley S (2003). "Improvements in transfection efficiency and tests of RNA interference (RNAi) approaches in the protozoan parasite Leishmania". Mol Biochem Parasitol. 128 (2): 217–28. doi:10.1016/S0166-6851(03)00079-3. PMID 12742588.
^ L. Aravind, Hidemi Watanabe, David J. Lipman, and Eugene V. Koonin (2000). "Lineage-specific loss and divergence of functionally linked genes in eukaryotes". Proceedings of the National Academy of Sciences. 97 (21): 11319–11324. Bibcode:2000PNAS...9711319A. doi:10.1073/pnas.200346997. PMC 17198. PMID 11016957.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Drinnenberg IA, Weinberg DE, Xie KT, Nower JP, Wolfe KH, Fink GR, Bartel DP (2009). "RNAi in Budding Yeast". Science. 326 (5952): 544–50. Bibcode:2009Sci...326..544D. doi:10.1126/science.1176945. PMID 19745116.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Nakayashiki H, Kadotani N, Mayama S (2006). "Evolution and diversification of RNA silencing proteins in fungi". J Mol Evol. 63 (1): 127–35. doi:10.1007/s00239-005-0257-2. PMID 16786437.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Morita T, Mochizuki Y, Aiba H (2006). "Translational repression is sufficient for gene silencing by bacterial small noncoding RNAs in the absence of mRNA destruction". Proc Natl Acad Sci USA. 103 (13): 4858–63. Bibcode:2006PNAS..103.4858M. doi:10.1073/pnas.0509638103. PMC 1458760. PMID 16549791.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Makarova K, Grishin N, Shabalina S, Wolf Y, Koonin E (2006). "A putative RNA-interference-based immune system in prokaryotes: computational analysis of the predicted enzymatic machinery, functional analogies with eukaryotic RNAi, and hypothetical mechanisms of action". Biol Direct. 1: 7. doi:10.1186/1745-6150-1-7. PMC 1462988. PMID 16545108.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Stram Y, Kuzntzova L (2006). "Inhibition of viruses by RNA interference". Virus Genes. 32 (3): 299–306. doi:10.1007/s11262-005-6914-0. PMID 16732482.
^ Blevins T, Rajeswaran R, Shivaprasad P, Beknazariants D, Si-Ammour A, Park H, Vazquez F, Robertson D, Meins F, Hohn T, Pooggin M (2006). "Four plant Dicers mediate viral small RNA biogenesis and DNA virus induced silencing". Nucleic Acids Res. 34 (21): 6233–46. doi:10.1093/nar/gkl886. PMC 1669714. PMID 17090584.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Palauqui J, Elmayan T, Pollien J, Vaucheret H (1997). "Systemic acquired silencing: transgene-specific post-transcriptional silencing is transmitted by grafting from silenced stocks to non-silenced scions". EMBO J. 16 (15): 4738–45. doi:10.1093/emboj/16.15.4738. PMC 1170100. PMID 9303318.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Voinnet O (2001). "RNA silencing as a plant immune system against viruses". Trends Genet. 17 (8): 449–59. doi:10.1016/S0168-9525(01)02367-8. PMID 11485817.
^ Mérai Z, Kerényi Z, Kertész S, Magna M, Lakatos L, Silhavy D (2006). "Double-Stranded RNA Binding May Be a General Plant RNA Viral Strategy To Suppress RNA Silencing". J Virol. 80 (12): 5747–56. doi:10.1128/JVI.01963-05. PMC 1472586. PMID 16731914.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Katiyar-Agarwal S, Morgan R, Dahlbeck D, Borsani O, Villegas A, Zhu J, Staskawicz B, Jin H (2006). "A pathogen-inducible endogenous siRNA in plant immunity". Proc Natl Acad Sci USA. 103 (47): 18002–7. Bibcode:2006PNAS..10318002K. doi:10.1073/pnas.0608258103. PMC 1693862. PMID 17071740.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Fritz J, Girardin S, Philpott D (2006). "Innate immune defense through RNA interference". Sci STKE. 2006 (339): pe27. doi:10.1126/stke.3392006pe27. PMID 16772641.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Zambon R, Vakharia V, Wu L (2006). "RNAi is an antiviral immune response against a dsRNA virus in Drosophila melanogaster". Cell Microbiol. 8 (5): 880–9. doi:10.1111/j.1462-5822.2006.00688.x. PMID 16611236.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Wang X, Aliyari R, Li W, Li H, Kim K, Carthew R, Atkinson P, Ding S (2006). "RNA Interference Directs Innate Immunity Against Viruses in Adult Drosophila". Science. 312 (5772): 452–4. Bibcode:2006Sci...312..452W. doi:10.1126/science.1125694. PMC 1509097. PMID 16556799.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Lu R, Maduro M, Li F, Li H, Broitman-Maduro G, Li W, Ding S (2005). "Animal virus replication and RNAi-mediated antiviral silencing in C elegans". Nature. 436 (7053): 1040–3. Bibcode:2005Natur.436.1040L. doi:10.1038/nature03870. PMC 1388260. PMID 16107851.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Wilkins C, Dishongh R, Moore S, Whitt M, Chow M, Machaca K (2005). "RNA interference is an antiviral defence mechanism in Caenorhabditis elegans". Nature. 436 (7053): 1044–7. Bibcode:2005Natur.436.1044W. doi:10.1038/nature03957. PMID 16107852.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Berkhout B, Haasnoot J (2006). "The interplay between virus infection and the cellular RNA interference machinery". FEBS Lett. 580 (12): 2896–902. doi:10.1016/j.febslet.2006.02.070. PMID 16563388.
^ Schütz S, Sarnow P (2006). "Interaction of viruses with the mammalian RNA interference pathway". Virology. 344 (1): 151–7. doi:10.1016/j.virol.2005.09.034. PMID 16364746.
^ Carrington J, Ambros V (2003). "Role of microRNAs in plant and animal development". Science. 301 (5631): 336–8. Bibcode:2003Sci...301..336C. doi:10.1126/science.1085242. PMID 12869753.
^ Lee R, Feinbaum R, Ambros V (1993). "The C. elegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with antisense complementarity to lin-14". Cell. 75 (5): 843–54. doi:10.1016/0092-8674(93)90529-Y. PMID 8252621.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Palatnik J, Allen E, Wu X, Schommer C, Schwab R, Carrington J, Weigel D (2003). "Control of leaf morphogenesis by microRNAs". Nature. 425 (6955): 257–63. Bibcode:2003Natur.425..257P. doi:10.1038/nature01958. PMID 12931144.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Zhang B, Pan X, Cobb G, Anderson T (2006). "Plant microRNA: a small regulatory molecule with big impact". Dev Biol. 289 (1): 3–16. doi:10.1016/j.ydbio.2005.10.036. PMID 16325172.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Jones-Rhoades M, Bartel D, Bartel B (2006). "MicroRNAS and their regulatory roles in plants". Annu Rev Plant Biol. 57: 19–53. doi:10.1146/annurev.arplant.57.032905.105218. PMID 16669754.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Zhang B, Pan X, Cobb G, Anderson T (2007). "microRNAs as oncogenes and tumor suppressors". Dev Biol. 302 (1): 1–12. doi:10.1016/j.ydbio.2006.08.028. PMID 16989803.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Cerutti H, Casas-Mollano J (2006). "On the origin and functions of RNA-mediated silencing: from protists to man". Curr Genet. 50 (2): 81–99. doi:10.1007/s00294-006-0078-x. PMC 2583075. PMID 16691418.
^ Anantharaman V, Koonin E, Aravind L (2002). "Comparative genomics and evolution of proteins involved in RNA metabolism". Nucleic Acids Res. 30 (7): 1427–64. doi:10.1093/nar/30.7.1427. PMC 101826. PMID 11917006.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Buchon N, Vaury C (2006). "RNAi: a defensive RNA-silencing against viruses and transposable elements". Heredity. 96 (2): 195–202. doi:10.1038/sj.hdy.6800789. PMID 16369574.
^ خطأ استشهاد: وسم <ref> غير سليم؛ لا نص تم توفيره للمراجع المسماة Lucy
^ Obbard D, Jiggins F, Halligan D, Little T (2006). "Natural selection drives extremely rapid evolution in antiviral RNAi genes". Curr Biol. 16 (6): 580–5. doi:10.1016/j.cub.2006.01.065. PMID 16546082.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Voorhoeve PM, Agami R (2003). "Knockdown stands up". Trends Biotechnol. 21 (1): 2–4. doi:10.1016/S0167-7799(02)00002-1. PMID 12480342.
^ Naito Y, Yamada T, Matsumiya T, Ui-Tei K, Saigo K, Morishita S (2005). "dsCheck: highly sensitive off-target search software for double-stranded RNA-mediated RNA interference". Nucleic Acids Res. 33 (Web Server issue): W589–91. doi:10.1093/nar/gki419. PMC 1160180. PMID 15980542.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Henschel A, Buchholz F, Habermann B (2004). "DEQOR: a web-based tool for the design and quality control of siRNAs". Nucleic Acids Res. 32 (Web Server issue): W113–20. doi:10.1093/nar/gkh408. PMC 441546. PMID 15215362.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Kamath R, Ahringer J (2003). "Genome-wide RNAi screening in Caenorhabditis elegans". Methods. 30 (4): 313–21. doi:10.1016/S1046-2023(03)00050-1. PMID 12828945.
^ Boutros M, Kiger A, Armknecht S, Kerr K, Hild M, Koch B, Haas S, Paro R, Perrimon N (2004). "Genome-wide RNAi analysis of growth and viability in Drosophila cells". Science. 303 (5659): 832–5. Bibcode:2004Sci...303..832B. doi:10.1126/science.1091266. PMID 14764878.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Fortunato A, Fraser A (2005). "Uncover genetic interactions in Caenorhabditis elegans by RNA interference". Biosci Rep. 25 (5–6): 299–307. doi:10.1007/s10540-005-2892-7. PMID 16307378.
^ Cullen L, Arndt G (2005). "Genome-wide screening for gene function using RNAi in mammalian cells". Immunol Cell Biol. 83 (3): 217–23. doi:10.1111/j.1440-1711.2005.01332.x. PMID 15877598.
^ Huesken D, Lange J, Mickanin C, Weiler J, Asselbergs F, Warner J, Meloon B, Engel S, Rosenberg A, Cohen D, Labow M, Reinhardt M, Natt F, Hall J (2005). "Design of a genome-wide siRNA library using an artificial neural network". Nat Biotechnol. 23 (8): 995–1001. doi:10.1038/nbt1118. PMID 16025102.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Ge G, Wong G, Luo B (2005). "Prediction of siRNA knockdown efficiency using artificial neural network models". Biochem Biophys Res Commun. 336 (2): 723–8. doi:10.1016/j.bbrc.2005.08.147. PMID 16153609.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Janitz M, Vanhecke D, Lehrach H (2006). "High-throughput RNA interference in functional genomics". Handb Exp Pharmacol. Handbook of Experimental Pharmacology. 173 (173): 97–104. doi:10.1007/3-540-27262-3_5. ISBN . PMID 16594612.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Vanhecke D, Janitz M (2005). "Functional genomics using high-throughput RNA interference". Drug Discov Today. 10 (3): 205–12. doi:10.1016/S1359-6446(04)03352-5. PMID 15708535.
^ Geldhof P, Murray L, Couthier A, Gilleard J, McLauchlan G, Knox D, Britton C (2006). "Testing the efficacy of RNA interference in Haemonchus contortus". Int J Parasitol. 36 (7): 801–10. doi:10.1016/j.ijpara.2005.12.004. PMID 16469321.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Geldhof P, Visser A, Clark D, Saunders G, Britton C, Gilleard J, Berriman M, Knox D. (2007). "RNA interference in parasitic helminths: current situation, potential pitfalls and future prospects". Parasitology. 134 (Pt 5): 1–11. doi:10.1017/S0031182006002071. PMID 17201997.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Travella S, Klimm T, Keller B (2006). "RNA Interference-Based Gene Silencing as an Efficient Tool for Functional Genomics in Hexaploid Bread Wheat". Plant Physiol. 142 (1): 6–20. doi:10.1104/pp.106.084517. PMC 1557595. PMID 16861570.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ McGinnis K, Chandler V, Cone K, Kaeppler H, Kaeppler S, Kerschen A, Pikaard C, Richards E, Sidorenko L, Smith T, Springer N, Wulan T (2005). "Transgene-induced RNA interference as a tool for plant functional genomics". Methods Enzymol. Methods in Enzymology. 392: 1–24. doi:10.1016/S0076-6879(04)92001-0. ISBN . PMID 15644172.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Paddison P, Caudy A, Hannon G (2002). "Stable suppression of gene expression by RNAi in mammalian cells". Proc Natl Acad Sci USA. 99 (3): 1443–8. Bibcode:2002PNAS...99.1443P. doi:10.1073/pnas.032652399. PMC 122210. PMID 11818553.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ . PMID 22432611. Missing or empty |title= (help)
^ Sah D (2006). "Therapeutic potential of RNA interference for neurological disorders". Life Sci. 79 (19): 1773–80. doi:10.1016/j.lfs.2006.06.011. PMID 16815477.
^ Zender L, Hutker S, Liedtke C, Tillmann H, Zender S, Mundt B, Waltemathe M, Gosling T, Flemming P, Malek N, Trautwein C, Manns M, Kuhnel F, Kubicka S (2003). "Caspaseثمانية small interfering RNA prevents acute liver failure in mice". Proc Natl Acad Sci USA. 100 (13): 7797–802. Bibcode:2003PNAS..100.7797Z. doi:10.1073/pnas.1330920100. PMC 164667. PMID 12810955.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Jiang M, Milner J (2002). "Selective silencing of viral gene expression in HPV-positive human cervical carcinoma cells treated with siRNA, a primer of RNA interference". Oncogene. 21 (39): 6041–8. doi:10.1038/sj.onc.1205878. PMID 12203116.
^ Crowe S (2003). "Suppression of chemokine receptor expression by RNA interference allows for inhibition of HIV-1 replication, by Martínez et al". AIDS. 17 Suppl 4: S103–5. PMID 15080188.
^ Kusov Y, Kanda T, Palmenberg A, Sgro J, Gauss-Müller V (2006). "Silencing of Hepatitis A Virus Infection by Small Interfering RNAs". J Virol. 80 (11): 5599–610. doi:10.1128/JVI.01773-05. PMC 1472172. PMID 16699041.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Jia F, Zhang Y, Liu C (2006). "A retrovirus-based system to stably silence hepatitis B virus genes by RNA interference". Biotechnol Lett. 28 (20): 1679–85. doi:10.1007/s10529-006-9138-z. PMID 16900331.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Hu L, Wang Z, Hu C, Liu X, Yao L, Li W, Qi Y (2005). "Inhibition of Measles virus multiplication in cell culture by RNA interference". Acta Virol. 49 (4): 227–34. PMID 16402679.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Raoul C, Barker S, Aebischer P (2006). "Viral-based modelling and correction of neurodegenerative diseases by RNA interference". Gene Ther. 13 (6): 487–95. doi:10.1038/sj.gt.3302690. PMID 16319945.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Putral L, Gu W, McMillan N (2006). "RNA interference for the treatment of cancer". Drug News Perspect. 19 (6): 317–24. doi:10.1358/dnp.2006.19.6.985937. PMID 16971967.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Izquierdo M (2005). "Short interfering RNAs as a tool for cancer gene therapy". Cancer Gene Ther. 12 (3): 217–27. doi:10.1038/sj.cgt.7700791. PMID 15550938.
^ Li C, Parker A, Menocal E, Xiang S, Borodyansky L, Fruehauf J (2006). "Delivery of RNA interference". Cell Cycle. 5 (18): 2103–9. doi:10.4161/cc.5.18.3192. PMID 16940756.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Takeshita F, Ochiya T (2006). "Therapeutic potential of RNA interference against cancer". Cancer Sci. 97 (8): 689–96. doi:10.1111/j.1349-7006.2006.00234.x. PMID 16863503.
^ Ma, Z (2005). "Cationic lipids enhance siRNA-mediated interferon response in mice". Biochemical and Biophysical Research Communications. 330 (3): 755–759. doi:10.1016/j.bbrc.2005.03.041. Unknown parameter |coauthors= ignored (|author= suggested) (help)CS1 maint: extra punctuation (link)
^ Morrissey, DV (2005). "Potent and persistent in vivo anti-HBV activity of chemically modified siRNAs". Nature Biotechnology. 23 (8): 1002–1007. doi:10.1038/nbt1122. Unknown parameter |coauthors= ignored (|author= suggested) (help)
^ Urban-Klein, B (2004). "RNAi-mediated gene-targeting through systemic application of polyethylenimine (PEI)-complexed siRNA in vivo". Gene Therapy. 12 (5): 461–466. doi:10.1038/sj.gt.3302425. Unknown parameter |coauthors= ignored (|author= suggested) (help)
^ Zintchenko, A (2008). "Simple modifications of branched PEI lead to highly efficient siRNA carriers with low toxicity". Bioconjugate Chemistry. 19 (7): 1448–1455. doi:10.1021/bc800065f. Unknown parameter |coauthors= ignored (|author= suggested) (help)
^ Bartlett, DW (2006). "Insights into the kinetics of siRNA-mediated gene silencing from live-cell and live-animal bioluminescent imaging". Nucleic Acids Research. 34 (1): 322–333. doi:10.1093/nar/gkj439. Unknown parameter |coauthors= ignored (|author= suggested) (help)
^ Tong A, Zhang Y, Nemunaitis J (2005). "Small interfering RNA for experimental cancer therapy". Curr Opin Mol Ther. 7 (2): 114–24. PMID 15844618.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Check, Erika. "RNA treatment kills mice". Nature. Nature Publishing Group. doi:10.1038/news060522-10. Retrieved 17 December 2012.
^ Grimm D, Streetz K, Jopling C, Storm T, Pandey K, Davis C, Marion P, Salazar F, Kay M (2006). "Fatality in mice due to oversaturation of cellular microRNA/short hairpin RNA pathways". Nature. 441 (7092): 537–41. Bibcode:2006Natur.441..537G. doi:10.1038/nature04791. PMID 16724069.CS1 maint: multiple names: authors list (link) خطأ استشهاد: وسم <ref> غير صالح؛ الاسم "Grimm" معهد أكثر من مرة بمحتويات مختلفة.
^ Berkhout, B; ter Brake, O (2010). "RNAi Gene Therapy to Control HIV-1 Infection". RNA Interference and Viruses: Current Innovations and Future Trends. Caister Academic Press. ISBN .CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Sunilkumar G, Campbell L, Puckhaber L, Stipanovic R, Rathore K (2006). "Engineering cottonseed for use in human nutrition by tissue-specific reduction of toxic gossypol". Proc Natl Acad Sci USA. 103 (48): 18054–9. Bibcode:2006PNAS..10318054S. doi:10.1073/pnas.0605389103. PMC 1838705. PMID 17110445.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Siritunga D, Sayre R (2003). "Generation of cyanogen-free transgenic cassava". Planta. 217 (3): 367–73. doi:10.1007/s00425-003-1005-8. PMID 14520563.
^ Le L, Lorenz Y, Scheurer S, Fötisch K, Enrique E, Bartra J, Biemelt S, Vieths S, Sonnewald U (2006). "Design of tomato fruits with reduced allergenicity by dsRNAi-mediated inhibition of ns-LTP (Lyc e 3) expression". Plant Biotechnol J. 4 (2): 231–42. doi:10.1111/j.1467-7652.2005.00175.x. PMID 17177799.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Sanders R, Hiatt W (2005). "Tomato transgene structure and silencing". Nat Biotechnol. 23 (3): 287–9. doi:10.1038/nbt0305-287b. PMID 15765076.
^ Chiang C, Wang J, Jan F, Yeh S, Gonsalves D (2001). "Comparative reactions of recombinant papaya ringspot viruses with chimeric coat protein (CP) genes and wild-type viruses on CP-transgenic papaya". J Gen Virol. 82 (Pt 11): 2827–36. PMID 11602796.CS1 maint: multiple names: authors list (link)
^ Matson RS (2005). Applying genomic and proteomic microarray technology in drug discovery. CRC Press. ISBN .
^ Zhang XHD (2011). . Cambridge University Press. ISBN .

[Daneholt2006-1] Daneholt, Bertil. "Advanced Information: RNA interference". The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2006. Archived from the original on 2007-01-20. Retrieved 2007-01-25.

[pmid15614608-2] Bagasra O, Prilliman KR (2004). "RNA interference: the molecular immune system" (PDF). J. Mol. Histol. 35 (6): 545–53. doi:10.1007/s10735-004-2192-8. PMID 15614608.

[Bernstein-3] Bernstein E, Caudy A, Hammond S, Hannon G (2001). "Role for a bidentate ribonuclease in the initiation step of RNA interference". Nature. 409 (6818): 363–6. doi:10.1038/35053110. PMID 11201747.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[4] Siomi, Haruhiko; Siomi, Mikiko C. (22 January 2009). "On the road to reading the RNA-interference code". Nature. 457 (7228): 396–404. Bibcode:2009Natur.457..396S. doi:10.1038/nature07754. PMID 19158785.

[Zamore-5] Zamore P, Tuschl T, Sharp P, Bartel D (2000). "RNAi: double-stranded RNA directs the ATP-dependent cleavage of mRNA at 21 to 23 nucleotide intervals". Cell. 101 (1): 25–33. doi:10.1016/S0092-8674(00)80620-0. PMID 10778853.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Vermeulen-6] Vermeulen A, Behlen L, Reynolds A, Wolfson A, Marshall W, Karpilow J, Khvorova A (2005). "The contributions of dsRNA structure to Dicer specificity and efficiency". RNA. 11 (5): 674–82. doi:10.1261/rna.7272305. PMC 1370754. PMID 15811921.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[7] Castanotto, Daniela; Rossi, John J. (22 January 2009). "The promises and pitfalls of RNA-interference-based therapeutics". Nature. 457 (7228): 426–433. Bibcode:2009Natur.457..426C. doi:10.1038/nature07758. PMC 2702667. PMID 19158789.

[Qiu-8] Qiu S, Adema C, Lane T (2005). "A computational study of off-target effects of RNA interference". Nucleic Acids Res. 33 (6): 1834–47. doi:10.1093/nar/gki324. PMC 1072799. PMID 15800213.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[9] Ahlquist P (2002). "RNA-dependent RNA polymerases, viruses, and RNA silencing". Science. 296 (5571): 1270–3. Bibcode:2002Sci...296.1270A. doi:10.1126/science.1069132. PMID 12016304.

[Parker-10] Parker G, Eckert D, Bass B (2006). "RDE-4 preferentially binds long dsRNA and its dimerization is necessary for cleavage of dsRNA to siRNA". RNA. 12 (5): 807–18. doi:10.1261/rna.2338706. PMC 1440910. PMID 16603715.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Liu2003-11] Liu Q, Rand T, Kalidas S, Du F, Kim H, Smith D, Wang X (2003). "R2D2, a bridge between the initiation and effector steps of the Drosophila RNAi pathway". Science. 301 (5641): 1921–5. Bibcode:2003Sci...301.1921L. doi:10.1126/science.1088710. PMID 14512631.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[12] Baulcombe D (2007). "Molecular biology. Amplified silencing". Science. 315 (5809): 199–200. doi:10.1126/science.1138030. PMID 17218517.

[Pak-13] Pak J, Fire A (2007). "Distinct populations of primary and secondary effectors during RNAi in C. elegans". Science. 315 (5809): 241–4. Bibcode:2007Sci...315..241P. doi:10.1126/science.1132839. PMID 17124291.

[Sijen-14] Sijen T, Steiner F, Thijssen K, Plasterk R (2007). "Secondary siRNAs result from unprimed RNA synthesis and form a distinct class". Science. 315 (5809): 244–7. Bibcode:2007Sci...315..244S. doi:10.1126/science.1136699. PMID 17158288.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[15] Wang QL, Li ZH (2007). "The functions of microRNAs in plants". Front. Biosci. 12: 3975–82. PMID 17485351.

[16] Zhao Y, Srivastava D (2007). "A developmental view of microRNA function". Trends Biochem. Sci. 32 (4): 189–97. doi:10.1016/j.tibs.2007.02.006. PMID 17350266.

[Denli-17] Gregory R, Chendrimada T, Shiekhattar R (2006). "MicroRNA biogenesis: isolation and characterization of the microprocessor complex". Methods Mol Biol. 342: 33–47. doi:10.1385/1-59745-123-1:33. ISBN . PMID 16957365.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Pillai_2006-18] Pillai RS, Bhattacharyya SN, Filipowicz W (2007). "Repression of protein synthesis by miRNAs: how many mechanisms?". Trends Cell Biol. 17 (3): 118–26. doi:10.1016/j.tcb.2006.12.007. PMID 17197185.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Okamura-19] Okamura K, Ishizuka A, Siomi H, Siomi M (2004). "Distinct roles for Argonaute proteins in small RNA-directed RNA cleavage pathways". Genes Dev. 18 (14): 1655–66. doi:10.1101/gad.1210204. PMC 478188. PMID 15231716.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Lee-20] Lee Y, Nakahara K, Pham J, Kim K, He Z, Sontheimer E, Carthew R (2004). "Distinct roles for Drosophila Dicer-1 and Dicer-2 in the siRNA/miRNA silencing pathways". Cell. 117 (1): 69–81. doi:10.1016/S0092-8674(04)00261-2. PMID 15066283.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Gregory-21] Gregory R, Chendrimada T, Cooch N, Shiekhattar R (2005). "Human RISC couples microRNA biogenesis and posttranscriptional gene silencing". Cell. 123 (4): 631–40. doi:10.1016/j.cell.2005.10.022. PMID 16271387.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Lodish-22] Lodish H, Berk A, Matsudaira P, Kaiser CA, Krieger M, Scott MP, Zipurksy SL, Darnell J (2004). (5th ed.). WH Freeman: New York, NY. ISBN .CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Matranga-23] Matranga C, Tomari Y, Shin C, Bartel D, Zamore P (2005). "Passenger-strand cleavage facilitates assembly of siRNA into Ago2-containing RNAi enzyme complexes". Cell. 123 (4): 607–20. doi:10.1016/j.cell.2005.08.044. PMID 16271386.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Leuschner-24] Leuschner P, Ameres S, Kueng S, Martinez J (2006). "Cleavage of the siRNA passenger strand during RISC assembly in human cells". EMBO Rep. 7 (3): 314–20. doi:10.1038/sj.embor.7400637. PMC 1456892. PMID 16439995.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Haley_2004_599.E2.80.93606-25] Haley, B (2004). "Kinetic analysis of the RNAi enzyme complex". Nature Structural & Molecular Biology. 11 (7): 599–606. doi:10.1038/nsmb780. Unknown parameter |coauthors= ignored (|author= suggested) (help)

[26] Schwarz DS, Hutvágner G, Du T, Xu Z, Aronin N, Zamore PD (2003). "Asymmetry in the assembly of the RNAi enzyme complex". Cell. 115 (2): 199–208. doi:10.1016/S0092-8674(03)00759-1. PMID 14567917.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Preall-27] Preall J, He Z, Gorra J, Sontheimer E (2006). "Short interfering RNA strand selection is independent of dsRNA processing polarity during RNAi in Drosophila". Curr Biol. 16 (5): 530–5. doi:10.1016/j.cub.2006.01.061. PMID 16527750.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Tomari-28] Tomari Y, Matranga C, Haley B, Martinez N, Zamore P (2004). "A protein sensor for siRNA asymmetry". Science. 306 (5700): 1377–80. Bibcode:2004Sci...306.1377T. doi:10.1126/science.1102755. PMID 15550672.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Ma-29] Ma J, Yuan Y, Meister G, Pei Y, Tuschl T, Patel D (2005). "Structural basis for 5'-end-specific recognition of guide RNA by the A. fulgidus Piwi protein". Nature. 434 (7033): 666–70. Bibcode:2005Natur.434..666M. doi:10.1038/nature03514. PMID 15800629.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Sen-30] Sen G, Wehrman T, Blau H (2005). "mRNA translation is not a prerequisite for small interfering RNA-mediated mRNA cleavage". Differentiation. 73 (6): 287–93. doi:10.1111/j.1432-0436.2005.00029.x. PMID 16138829.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Gu-31] Gu S, Rossi J (2005). "Uncoupling of RNAi from active translation in mammalian cells". RNA. 11 (1): 38–44. doi:10.1261/rna.7158605. PMC 1370689. PMID 15574516.

[SenBlau-32] Sen G, Blau H (2005). "Argonaute 2/RISC resides in sites of mammalian mRNA decay known as cytoplasmic bodies". Nat Cell Biol. 7 (6): 633–6. doi:10.1038/ncb1265. PMID 15908945.

[Holmquist_2006-33] Holmquist G, Ashley T (2006). "Chromosome organization and chromatin modification: influence on genome function and evolution". Cytogenet Genome Res. 114 (2): 96–125. doi:10.1159/000093326. PMID 16825762.

[Verdel-34] Verdel A, Jia S, Gerber S, Sugiyama T, Gygi S, Grewal S, Moazed D (2004). "RNAi-mediated targeting of heterochromatin by the RITS complex". Science. 303 (5658): 672–6. Bibcode:2004Sci...303..672V. doi:10.1126/science.1093686. PMC 3244756. PMID 14704433.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Irvine-35] Irvine D, Zaratiegui M, Tolia N, Goto D, Chitwood D, Vaughn M, Joshua-Tor L, Martienssen R (2006). "Argonaute slicing is required for heterochromatic silencing and spreading". Science. 313 (5790): 1134–7. Bibcode:2006Sci...313.1134I. doi:10.1126/science.1128813. PMID 16931764.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Volpe_2002-36] Volpe T, Kidner C, Hall I, Teng G, Grewal S, Martienssen R (2002). "Regulation of heterochromatic silencing and histone H3 lysine-9 methylation by RNAi". Science. 297 (5588): 1833–7. Bibcode:2002Sci...297.1833V. doi:10.1126/science.1074973. PMID 12193640.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Volpe_2003-37] Volpe T, Schramke V, Hamilton G, White S, Teng G, Martienssen R, Allshire R (2003). "RNA interference is required for normal centromere function in fission yeast". Chromosome Res. 11 (2): 137–46. doi:10.1023/A:1022815931524. PMID 12733640.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Li-38] Li LC, Okino ST, Zhao H, Pookot D, Place RF, Urakami S, Enokida H, Dahiya R (2006). "Small dsRNAs induce transcriptional activation in human cells". Proc Natl Acad Sci USA. 103 (46): 17337–42. Bibcode:2006PNAS..10317337L. doi:10.1073/pnas.0607015103. PMC 1859931. PMID 17085592.CS1 maint: multiple names: authors list (link) خطأ استشهاد: وسم <ref> غير صالح؛ الاسم "Li" معهد أكثر من مرة بمحتويات مختلفة. خطأ استشهاد: وسم <ref> غير صالح؛ الاسم "Li" معهد أكثر من مرة بمحتويات مختلفة.

[Noma-39] Noma K, Sugiyama T, Cam H, Verdel A, Zofall M, Jia S, Moazed D, Grewal S (2004). "RITS acts in cis to promote RNA interference-mediated transcriptional and post-transcriptional silencing". Nat Genet. 36 (11): 1174–80. doi:10.1038/ng1452. PMID 15475954.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Bass_2002-40] Bass B (2002). "RNA Editing by Adenosine Deaminases That Act on RNA". Annu Rev Biochem. 71: 817–46. doi:10.1146/annurev.biochem.71.110601.135501. PMC 1823043. PMID 12045112.

[Bass_2000-41] Bass B (2000). "Double-stranded RNA as a template for gene silencing". Cell. 101 (3): 235–8. doi:10.1016/S0092-8674(02)71133-1. PMID 10847677.

[Luciano_2004-42] Luciano D, Mirsky H, Vendetti N, Maas S (2004). "RNA editing of a miRNA precursor". RNA. 10 (8): 1174–7. doi:10.1261/rna.7350304. PMC 1370607. PMID 15272117.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[yang2006-43] Yang W, Chendrimada T, Wang Q, Higuchi M, Seeburg P, Shiekhattar R, Nishikura K (2006). "Modulation of microRNA processing and expression through RNA editing by ADAR deaminases". Nat Struct Mol Biol. 13 (1): 13–21. doi:10.1038/nsmb1041. PMC 2950615. PMID 16369484.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Yang_2005-44] Yang W, Wang Q, Howell K, Lee J, Cho D, Murray J, Nishikura K (2005). "ADAR1 RNA Deaminase Limits Short Interfering RNA Efficacy in Mammalian Cells". J Biol Chem. 280 (5): 3946–53. doi:10.1074/jbc.M407876200. PMC 2947832. PMID 15556947.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Nishikura_2006-45] Nishikura K (2006). "Editor meets silencer: crosstalk between RNA editing and RNA interference". Nat Rev Mol Cell Biol. 7 (12): 919–31. doi:10.1038/nrm2061. PMC 2953463. PMID 17139332.

[46] Jones L, Ratcliff F, Baulcombe DC (2001). "RNA-directed transcriptional gene silencing in plants can be inherited independently of the RNA trigger and requires Met1 for maintenance". Current Biology. 11 (10): 747–757. doi:10.1016/S0960-9822(01)00226-3. PMID 11378384.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Saumet-47] خطأ استشهاد: وسم <ref> غير سليم؛ لا نص تم توفيره للمراجع المسماة Saumet

[Humphreys-48] Humphreys DT, Westman BJ, Martin DI, Preiss T (2005). "MicroRNAs control translation initiation by inhibiting eukaryotic initiation factor 4E/cap and poly(A) tail function". Proc Natl Acad Sci USA. 102 (47): 16961–16966. Bibcode:2005PNAS..10216961H. doi:10.1073/pnas.0506482102. PMC 1287990. PMID 16287976.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[DaRocha_2004-49] DaRocha W, Otsu K, Teixeira S, Donelson J (2004). "Tests of cytoplasmic RNA interference (RNAi) and construction of a tetracycline-inducible T7 promoter system in Trypanosoma cruzi". Mol Biochem Parasitol. 133 (2): 175–86. doi:10.1016/j.molbiopara.2003.10.005. PMID 14698430.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Robinson_2003-50] Robinson K, Beverley S (2003). "Improvements in transfection efficiency and tests of RNA interference (RNAi) approaches in the protozoan parasite Leishmania". Mol Biochem Parasitol. 128 (2): 217–28. doi:10.1016/S0166-6851(03)00079-3. PMID 12742588.

[Aravind-51] L. Aravind, Hidemi Watanabe, David J. Lipman, and Eugene V. Koonin (2000). "Lineage-specific loss and divergence of functionally linked genes in eukaryotes". Proceedings of the National Academy of Sciences. 97 (21): 11319–11324. Bibcode:2000PNAS...9711319A. doi:10.1073/pnas.200346997. PMC 17198. PMID 11016957.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[52] Drinnenberg IA, Weinberg DE, Xie KT, Nower JP, Wolfe KH, Fink GR, Bartel DP (2009). "RNAi in Budding Yeast". Science. 326 (5952): 544–50. Bibcode:2009Sci...326..544D. doi:10.1126/science.1176945. PMID 19745116.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Nakayashiki-53] Nakayashiki H, Kadotani N, Mayama S (2006). "Evolution and diversification of RNA silencing proteins in fungi". J Mol Evol. 63 (1): 127–35. doi:10.1007/s00239-005-0257-2. PMID 16786437.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Morita_2006-54] Morita T, Mochizuki Y, Aiba H (2006). "Translational repression is sufficient for gene silencing by bacterial small noncoding RNAs in the absence of mRNA destruction". Proc Natl Acad Sci USA. 103 (13): 4858–63. Bibcode:2006PNAS..103.4858M. doi:10.1073/pnas.0509638103. PMC 1458760. PMID 16549791.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[makarova-55] Makarova K, Grishin N, Shabalina S, Wolf Y, Koonin E (2006). "A putative RNA-interference-based immune system in prokaryotes: computational analysis of the predicted enzymatic machinery, functional analogies with eukaryotic RNAi, and hypothetical mechanisms of action". Biol Direct. 1: 7. doi:10.1186/1745-6150-1-7. PMC 1462988. PMID 16545108.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Stram_2006-56] Stram Y, Kuzntzova L (2006). "Inhibition of viruses by RNA interference". Virus Genes. 32 (3): 299–306. doi:10.1007/s11262-005-6914-0. PMID 16732482.

[Blevins-57] Blevins T, Rajeswaran R, Shivaprasad P, Beknazariants D, Si-Ammour A, Park H, Vazquez F, Robertson D, Meins F, Hohn T, Pooggin M (2006). "Four plant Dicers mediate viral small RNA biogenesis and DNA virus induced silencing". Nucleic Acids Res. 34 (21): 6233–46. doi:10.1093/nar/gkl886. PMC 1669714. PMID 17090584.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Palauqui-58] Palauqui J, Elmayan T, Pollien J, Vaucheret H (1997). "Systemic acquired silencing: transgene-specific post-transcriptional silencing is transmitted by grafting from silenced stocks to non-silenced scions". EMBO J. 16 (15): 4738–45. doi:10.1093/emboj/16.15.4738. PMC 1170100. PMID 9303318.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Voinnet-59] Voinnet O (2001). "RNA silencing as a plant immune system against viruses". Trends Genet. 17 (8): 449–59. doi:10.1016/S0168-9525(01)02367-8. PMID 11485817.

[Merai-60] Mérai Z, Kerényi Z, Kertész S, Magna M, Lakatos L, Silhavy D (2006). "Double-Stranded RNA Binding May Be a General Plant RNA Viral Strategy To Suppress RNA Silencing". J Virol. 80 (12): 5747–56. doi:10.1128/JVI.01963-05. PMC 1472586. PMID 16731914.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Katiyar-Agarwal-61] Katiyar-Agarwal S, Morgan R, Dahlbeck D, Borsani O, Villegas A, Zhu J, Staskawicz B, Jin H (2006). "A pathogen-inducible endogenous siRNA in plant immunity". Proc Natl Acad Sci USA. 103 (47): 18002–7. Bibcode:2006PNAS..10318002K. doi:10.1073/pnas.0608258103. PMC 1693862. PMID 17071740.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Fritz-62] Fritz J, Girardin S, Philpott D (2006). "Innate immune defense through RNA interference". Sci STKE. 2006 (339): pe27. doi:10.1126/stke.3392006pe27. PMID 16772641.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Zambon-63] Zambon R, Vakharia V, Wu L (2006). "RNAi is an antiviral immune response against a dsRNA virus in Drosophila melanogaster". Cell Microbiol. 8 (5): 880–9. doi:10.1111/j.1462-5822.2006.00688.x. PMID 16611236.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Wang-64] Wang X, Aliyari R, Li W, Li H, Kim K, Carthew R, Atkinson P, Ding S (2006). "RNA Interference Directs Innate Immunity Against Viruses in Adult Drosophila". Science. 312 (5772): 452–4. Bibcode:2006Sci...312..452W. doi:10.1126/science.1125694. PMC 1509097. PMID 16556799.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Lu-65] Lu R, Maduro M, Li F, Li H, Broitman-Maduro G, Li W, Ding S (2005). "Animal virus replication and RNAi-mediated antiviral silencing in C elegans". Nature. 436 (7053): 1040–3. Bibcode:2005Natur.436.1040L. doi:10.1038/nature03870. PMC 1388260. PMID 16107851.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Wilkins-66] Wilkins C, Dishongh R, Moore S, Whitt M, Chow M, Machaca K (2005). "RNA interference is an antiviral defence mechanism in Caenorhabditis elegans". Nature. 436 (7053): 1044–7. Bibcode:2005Natur.436.1044W. doi:10.1038/nature03957. PMID 16107852.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Berkhout-67] Berkhout B, Haasnoot J (2006). "The interplay between virus infection and the cellular RNA interference machinery". FEBS Lett. 580 (12): 2896–902. doi:10.1016/j.febslet.2006.02.070. PMID 16563388.

[Schutz-68] Schütz S, Sarnow P (2006). "Interaction of viruses with the mammalian RNA interference pathway". Virology. 344 (1): 151–7. doi:10.1016/j.virol.2005.09.034. PMID 16364746.

[Carrington-69] Carrington J, Ambros V (2003). "Role of microRNAs in plant and animal development". Science. 301 (5631): 336–8. Bibcode:2003Sci...301..336C. doi:10.1126/science.1085242. PMID 12869753.

[Lee_1993-70] Lee R, Feinbaum R, Ambros V (1993). "The C. elegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with antisense complementarity to lin-14". Cell. 75 (5): 843–54. doi:10.1016/0092-8674(93)90529-Y. PMID 8252621.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Palatnik_2003-71] Palatnik J, Allen E, Wu X, Schommer C, Schwab R, Carrington J, Weigel D (2003). "Control of leaf morphogenesis by microRNAs". Nature. 425 (6955): 257–63. Bibcode:2003Natur.425..257P. doi:10.1038/nature01958. PMID 12931144.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Zhang_plant-72] Zhang B, Pan X, Cobb G, Anderson T (2006). "Plant microRNA: a small regulatory molecule with big impact". Dev Biol. 289 (1): 3–16. doi:10.1016/j.ydbio.2005.10.036. PMID 16325172.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Jones-Rhoades-73] Jones-Rhoades M, Bartel D, Bartel B (2006). "MicroRNAS and their regulatory roles in plants". Annu Rev Plant Biol. 57: 19–53. doi:10.1146/annurev.arplant.57.032905.105218. PMID 16669754.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Zhang_cancer-74] Zhang B, Pan X, Cobb G, Anderson T (2007). "microRNAs as oncogenes and tumor suppressors". Dev Biol. 302 (1): 1–12. doi:10.1016/j.ydbio.2006.08.028. PMID 16989803.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Cerutti-75] Cerutti H, Casas-Mollano J (2006). "On the origin and functions of RNA-mediated silencing: from protists to man". Curr Genet. 50 (2): 81–99. doi:10.1007/s00294-006-0078-x. PMC 2583075. PMID 16691418.

[Anantharaman-76] Anantharaman V, Koonin E, Aravind L (2002). "Comparative genomics and evolution of proteins involved in RNA metabolism". Nucleic Acids Res. 30 (7): 1427–64. doi:10.1093/nar/30.7.1427. PMC 101826. PMID 11917006.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Buchon-77] Buchon N, Vaury C (2006). "RNAi: a defensive RNA-silencing against viruses and transposable elements". Heredity. 96 (2): 195–202. doi:10.1038/sj.hdy.6800789. PMID 16369574.

[Lucy-78] خطأ استشهاد: وسم <ref> غير سليم؛ لا نص تم توفيره للمراجع المسماة Lucy

[Obbard-79] Obbard D, Jiggins F, Halligan D, Little T (2006). "Natural selection drives extremely rapid evolution in antiviral RNAi genes". Curr Biol. 16 (6): 580–5. doi:10.1016/j.cub.2006.01.065. PMID 16546082.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[pmid12480342-80] Voorhoeve PM, Agami R (2003). "Knockdown stands up". Trends Biotechnol. 21 (1): 2–4. doi:10.1016/S0167-7799(02)00002-1. PMID 12480342.

[Naito_ds-81] Naito Y, Yamada T, Matsumiya T, Ui-Tei K, Saigo K, Morishita S (2005). "dsCheck: highly sensitive off-target search software for double-stranded RNA-mediated RNA interference". Nucleic Acids Res. 33 (Web Server issue): W589–91. doi:10.1093/nar/gki419. PMC 1160180. PMID 15980542.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Henschel-82] Henschel A, Buchholz F, Habermann B (2004). "DEQOR: a web-based tool for the design and quality control of siRNAs". Nucleic Acids Res. 32 (Web Server issue): W113–20. doi:10.1093/nar/gkh408. PMC 441546. PMID 15215362.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Kamath-83] Kamath R, Ahringer J (2003). "Genome-wide RNAi screening in Caenorhabditis elegans". Methods. 30 (4): 313–21. doi:10.1016/S1046-2023(03)00050-1. PMID 12828945.

[Boutros-84] Boutros M, Kiger A, Armknecht S, Kerr K, Hild M, Koch B, Haas S, Paro R, Perrimon N (2004). "Genome-wide RNAi analysis of growth and viability in Drosophila cells". Science. 303 (5659): 832–5. Bibcode:2004Sci...303..832B. doi:10.1126/science.1091266. PMID 14764878.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Fortunato_2005-85] Fortunato A, Fraser A (2005). "Uncover genetic interactions in Caenorhabditis elegans by RNA interference". Biosci Rep. 25 (5–6): 299–307. doi:10.1007/s10540-005-2892-7. PMID 16307378.

[Cullen_genome-86] Cullen L, Arndt G (2005). "Genome-wide screening for gene function using RNAi in mammalian cells". Immunol Cell Biol. 83 (3): 217–23. doi:10.1111/j.1440-1711.2005.01332.x. PMID 15877598.

[Huesken-87] Huesken D, Lange J, Mickanin C, Weiler J, Asselbergs F, Warner J, Meloon B, Engel S, Rosenberg A, Cohen D, Labow M, Reinhardt M, Natt F, Hall J (2005). "Design of a genome-wide siRNA library using an artificial neural network". Nat Biotechnol. 23 (8): 995–1001. doi:10.1038/nbt1118. PMID 16025102.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Ge-88] Ge G, Wong G, Luo B (2005). "Prediction of siRNA knockdown efficiency using artificial neural network models". Biochem Biophys Res Commun. 336 (2): 723–8. doi:10.1016/j.bbrc.2005.08.147. PMID 16153609.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Janitz-89] Janitz M, Vanhecke D, Lehrach H (2006). "High-throughput RNA interference in functional genomics". Handb Exp Pharmacol. Handbook of Experimental Pharmacology. 173 (173): 97–104. doi:10.1007/3-540-27262-3_5. ISBN . PMID 16594612.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Vanhecke-90] Vanhecke D, Janitz M (2005). "Functional genomics using high-throughput RNA interference". Drug Discov Today. 10 (3): 205–12. doi:10.1016/S1359-6446(04)03352-5. PMID 15708535.

[Geldhof-91] Geldhof P, Murray L, Couthier A, Gilleard J, McLauchlan G, Knox D, Britton C (2006). "Testing the efficacy of RNA interference in Haemonchus contortus". Int J Parasitol. 36 (7): 801–10. doi:10.1016/j.ijpara.2005.12.004. PMID 16469321.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Geldhof2-92] Geldhof P, Visser A, Clark D, Saunders G, Britton C, Gilleard J, Berriman M, Knox D. (2007). "RNA interference in parasitic helminths: current situation, potential pitfalls and future prospects". Parasitology. 134 (Pt 5): 1–11. doi:10.1017/S0031182006002071. PMID 17201997.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Travella-93] Travella S, Klimm T, Keller B (2006). "RNA Interference-Based Gene Silencing as an Efficient Tool for Functional Genomics in Hexaploid Bread Wheat". Plant Physiol. 142 (1): 6–20. doi:10.1104/pp.106.084517. PMC 1557595. PMID 16861570.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[McGinnis-94] McGinnis K, Chandler V, Cone K, Kaeppler H, Kaeppler S, Kerschen A, Pikaard C, Richards E, Sidorenko L, Smith T, Springer N, Wulan T (2005). "Transgene-induced RNA interference as a tool for plant functional genomics". Methods Enzymol. Methods in Enzymology. 392: 1–24. doi:10.1016/S0076-6879(04)92001-0. ISBN . PMID 15644172.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Paddison-95] Paddison P, Caudy A, Hannon G (2002). "Stable suppression of gene expression by RNAi in mammalian cells". Proc Natl Acad Sci USA. 99 (3): 1443–8. Bibcode:2002PNAS...99.1443P. doi:10.1073/pnas.032652399. PMC 122210. PMID 11818553.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[96] . PMID 22432611. Missing or empty |title= (help)

[Sah-97] Sah D (2006). "Therapeutic potential of RNA interference for neurological disorders". Life Sci. 79 (19): 1773–80. doi:10.1016/j.lfs.2006.06.011. PMID 16815477.

[Zender-98] Zender L, Hutker S, Liedtke C, Tillmann H, Zender S, Mundt B, Waltemathe M, Gosling T, Flemming P, Malek N, Trautwein C, Manns M, Kuhnel F, Kubicka S (2003). "Caspaseثمانية small interfering RNA prevents acute liver failure in mice". Proc Natl Acad Sci USA. 100 (13): 7797–802. Bibcode:2003PNAS..100.7797Z. doi:10.1073/pnas.1330920100. PMC 164667. PMID 12810955.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Jiang-99] Jiang M, Milner J (2002). "Selective silencing of viral gene expression in HPV-positive human cervical carcinoma cells treated with siRNA, a primer of RNA interference". Oncogene. 21 (39): 6041–8. doi:10.1038/sj.onc.1205878. PMID 12203116.

[100] Crowe S (2003). "Suppression of chemokine receptor expression by RNA interference allows for inhibition of HIV-1 replication, by Martínez et al". AIDS. 17 Suppl 4: S103–5. PMID 15080188.

[Kusov-101] Kusov Y, Kanda T, Palmenberg A, Sgro J, Gauss-Müller V (2006). "Silencing of Hepatitis A Virus Infection by Small Interfering RNAs". J Virol. 80 (11): 5599–610. doi:10.1128/JVI.01773-05. PMC 1472172. PMID 16699041.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Jia-102] Jia F, Zhang Y, Liu C (2006). "A retrovirus-based system to stably silence hepatitis B virus genes by RNA interference". Biotechnol Lett. 28 (20): 1679–85. doi:10.1007/s10529-006-9138-z. PMID 16900331.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Hu-103] Hu L, Wang Z, Hu C, Liu X, Yao L, Li W, Qi Y (2005). "Inhibition of Measles virus multiplication in cell culture by RNA interference". Acta Virol. 49 (4): 227–34. PMID 16402679.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Raoul-104] Raoul C, Barker S, Aebischer P (2006). "Viral-based modelling and correction of neurodegenerative diseases by RNA interference". Gene Ther. 13 (6): 487–95. doi:10.1038/sj.gt.3302690. PMID 16319945.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Putral-105] Putral L, Gu W, McMillan N (2006). "RNA interference for the treatment of cancer". Drug News Perspect. 19 (6): 317–24. doi:10.1358/dnp.2006.19.6.985937. PMID 16971967.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Izquierdo-106] Izquierdo M (2005). "Short interfering RNAs as a tool for cancer gene therapy". Cancer Gene Ther. 12 (3): 217–27. doi:10.1038/sj.cgt.7700791. PMID 15550938.

[Li_delivery-107] Li C, Parker A, Menocal E, Xiang S, Borodyansky L, Fruehauf J (2006). "Delivery of RNA interference". Cell Cycle. 5 (18): 2103–9. doi:10.4161/cc.5.18.3192. PMID 16940756.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Takeshita-108] Takeshita F, Ochiya T (2006). "Therapeutic potential of RNA interference against cancer". Cancer Sci. 97 (8): 689–96. doi:10.1111/j.1349-7006.2006.00234.x. PMID 16863503.

[109] Ma, Z (2005). "Cationic lipids enhance siRNA-mediated interferon response in mice". Biochemical and Biophysical Research Communications. 330 (3): 755–759. doi:10.1016/j.bbrc.2005.03.041. Unknown parameter |coauthors= ignored (|author= suggested) (help)CS1 maint: extra punctuation (link)

[110] Morrissey, DV (2005). "Potent and persistent in vivo anti-HBV activity of chemically modified siRNAs". Nature Biotechnology. 23 (8): 1002–1007. doi:10.1038/nbt1122. Unknown parameter |coauthors= ignored (|author= suggested) (help)

[111] Urban-Klein, B (2004). "RNAi-mediated gene-targeting through systemic application of polyethylenimine (PEI)-complexed siRNA in vivo". Gene Therapy. 12 (5): 461–466. doi:10.1038/sj.gt.3302425. Unknown parameter |coauthors= ignored (|author= suggested) (help)

[112] Zintchenko, A (2008). "Simple modifications of branched PEI lead to highly efficient siRNA carriers with low toxicity". Bioconjugate Chemistry. 19 (7): 1448–1455. doi:10.1021/bc800065f. Unknown parameter |coauthors= ignored (|author= suggested) (help)

[113] Bartlett, DW (2006). "Insights into the kinetics of siRNA-mediated gene silencing from live-cell and live-animal bioluminescent imaging". Nucleic Acids Research. 34 (1): 322–333. doi:10.1093/nar/gkj439. Unknown parameter |coauthors= ignored (|author= suggested) (help)

[Tong-114] Tong A, Zhang Y, Nemunaitis J (2005). "Small interfering RNA for experimental cancer therapy". Curr Opin Mol Ther. 7 (2): 114–24. PMID 15844618.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[115] Check, Erika. "RNA treatment kills mice". Nature. Nature Publishing Group. doi:10.1038/news060522-10. Retrieved 17 December 2012.

[Grimm-116] Grimm D, Streetz K, Jopling C, Storm T, Pandey K, Davis C, Marion P, Salazar F, Kay M (2006). "Fatality in mice due to oversaturation of cellular microRNA/short hairpin RNA pathways". Nature. 441 (7092): 537–41. Bibcode:2006Natur.441..537G. doi:10.1038/nature04791. PMID 16724069.CS1 maint: multiple names: authors list (link) خطأ استشهاد: وسم <ref> غير صالح؛ الاسم "Grimm" معهد أكثر من مرة بمحتويات مختلفة.

[Berkhout1-117] Berkhout, B; ter Brake, O (2010). "RNAi Gene Therapy to Control HIV-1 Infection". RNA Interference and Viruses: Current Innovations and Future Trends. Caister Academic Press. ISBN .CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Sunilkumar-118] Sunilkumar G, Campbell L, Puckhaber L, Stipanovic R, Rathore K (2006). "Engineering cottonseed for use in human nutrition by tissue-specific reduction of toxic gossypol". Proc Natl Acad Sci USA. 103 (48): 18054–9. Bibcode:2006PNAS..10318054S. doi:10.1073/pnas.0605389103. PMC 1838705. PMID 17110445.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Siritunga-119] Siritunga D, Sayre R (2003). "Generation of cyanogen-free transgenic cassava". Planta. 217 (3): 367–73. doi:10.1007/s00425-003-1005-8. PMID 14520563.

[Le_tomato-120] Le L, Lorenz Y, Scheurer S, Fötisch K, Enrique E, Bartra J, Biemelt S, Vieths S, Sonnewald U (2006). "Design of tomato fruits with reduced allergenicity by dsRNAi-mediated inhibition of ns-LTP (Lyc e 3) expression". Plant Biotechnol J. 4 (2): 231–42. doi:10.1111/j.1467-7652.2005.00175.x. PMID 17177799.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[Sanders-121] Sanders R, Hiatt W (2005). "Tomato transgene structure and silencing". Nat Biotechnol. 23 (3): 287–9. doi:10.1038/nbt0305-287b. PMID 15765076.

[Chiang-122] Chiang C, Wang J, Jan F, Yeh S, Gonsalves D (2001). "Comparative reactions of recombinant papaya ringspot viruses with chimeric coat protein (CP) genes and wild-type viruses on CP-transgenic papaya". J Gen Virol. 82 (Pt 11): 2827–36. PMID 11602796.CS1 maint: multiple names: authors list (link)

[-123] Matson RS (2005). Applying genomic and proteomic microarray technology in drug discovery. CRC Press. ISBN .

[ZhangXHD-124] Zhang XHD (2011). . Cambridge University Press. ISBN .