SATB1

SATB1
التراكيب المتوفرة
بنك بيانات البروتين	Ortholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معهدات بنك بيانات البروتين
	1YSE, 2L1P, 2O49, 2O4A, 3NZL, 3TUO, 2MW8
المعهدات
الأسماء المستعارة	SATB1, SATB homeobox 1
معهدات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 602075 MGI: MGI:105084 HomoloGene: 2232 GeneCards: 6304
فهم الوجود الجيني
الوظيفة الجزيئية	• ربط دي إذا إي; • RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding; • ‏GO:0001131، ‏GO:0001151، ‏GO:0001130، ‏GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • chromatin binding; • ‏GO:0001948 ربط بروتيني; • ‏GO:0001078، ‏GO:0001214، ‏GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • double-stranded DNA binding; • ‏GO:0001200، ‏GO:0001133، ‏GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • sequence-specific DNA binding;
المكونات الخلوية	• PML body; • مصفوفة نووية; • بلازم نووي; • nuclear heterochromatin; • كروماتين; • نواة; • نقاط نووية;
العمليات الحيوية	• منعكس; • CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation; • CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation; • تغيير بنية الكروماتين; • activated T cell proliferation; • ضبط نسخ الدنا; • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • chromatin organization; • نسخ الدنا; • epidermis development; • مثيلة الهستونات; • viral process; • T cell activation;
	المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
	المزيد من بيانات التعبير المرجعية
أورثولوج
	Q01826; C9J3I0
	Q60611
	‏NM_001131010، ‏NM_001195470، ‏NM_002971، ‏XM_011533988، ‏XM_011533989، ‏NM_001322871، ‏NM_001322872، ‏NM_001322873، ‏NM_001322874، ‏NM_001322875، ‏NM_001322876 XM_011533990، ‏NM_001131010، ‏NM_001195470، ‏NM_002971، ‏XM_011533988، ‏XM_011533989، ‏NM_001322871، ‏NM_001322872، ‏NM_001322873، ‏NM_001322874، ‏NM_001322875، ‏NM_001322876
	‏NM_001163631، ‏NM_001163632، ‏NM_009122، ‏XM_006523924، ‏XM_006523925، ‏XM_006523926، ‏XM_006523927، ‏XM_017317363، ‏XM_017317365، ‏XM_017317366، ‏NM_001357636، ‏NM_001357637، ‏NM_001357638، ‏NM_001357640 NM_001163630، ‏NM_001163631، ‏NM_001163632، ‏NM_009122، ‏XM_006523924، ‏XM_006523925، ‏XM_006523926، ‏XM_006523927، ‏XM_017317363، ‏XM_017317365، ‏XM_017317366، ‏NM_001357636، ‏NM_001357637، ‏NM_001357638، ‏NM_001357640
	‏NP_001182399، ‏NP_001309800، ‏NP_001309801، ‏NP_001309802، ‏NP_001309803، ‏NP_001309804، ‏NP_001309805، ‏NP_002962، ‏XP_011532290، ‏XP_011532291، ‏XP_011532292 NP_001124482، ‏NP_001182399، ‏NP_001309800، ‏NP_001309801، ‏NP_001309802، ‏NP_001309803، ‏NP_001309804، ‏NP_001309805، ‏NP_002962، ‏XP_011532290، ‏XP_011532291، ‏XP_011532292
	‏NP_001157103، ‏NP_001157104، ‏NP_033148، ‏XP_006523987، ‏XP_006523988، ‏XP_006523989، ‏XP_006523990، ‏XP_017172852، ‏XP_017172854، ‏XP_017172855، ‏NP_001344565، ‏NP_001344566، ‏NP_001344567، ‏NP_001344569 NP_001157102، ‏NP_001157103، ‏NP_001157104، ‏NP_033148، ‏XP_006523987، ‏XP_006523988، ‏XP_006523989، ‏XP_006523990، ‏XP_017172852، ‏XP_017172854، ‏XP_017172855، ‏NP_001344565، ‏NP_001344566، ‏NP_001344567، ‏NP_001344569
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

SATB1‏ (SATB homeobox 1) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين SATB1 في الإنسان.

الوظيفة

هذا القسم فارغ أوغير مكتمل، ساهم بتحريره.

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أوغير مكتمل، ساهم بتحريره.

المراجع

^ "Entrez Gene: SATB1 SATB homeobox 1". مؤرشف من الأصل في 05 ديسمبر 2010.

قراءة متعمقة

Dickinson LA, Joh T, Kohwi Y, Kohwi-Shigematsu T (Aug 1992). "A tissue-specific MAR/SAR DNA-binding protein with unusual binding site recognition". Cell. 70 (4): 631–45. doi:10.1016/0092-8674(92)90432-C. PMID 1505028.
Robertson NG, Khetarpal U, Gutiérrez-Espeleta GA, Bieber FR, Morton CC (Sep 1994). "Isolation of novel and known genes from a human fetal cochlear cDNA library using subtractive hybridization and differential screening". Genomics. 23 (1): 42–50. doi:10.1006/geno.1994.1457. PMID 7829101.
Nakagomi K, Kohwi Y, Dickinson LA, Kohwi-Shigematsu T (Mar 1994). "A novel DNA-binding motif in the nuclear matrix attachment DNA-binding protein SATB1". Molecular and Cellular Biology. 14 (3): 1852–60. PMC 358543. PMID 8114718.
Xu L, Deng HX, Xia JH, Yang Y, Fan CH, Hung WY, Siddque T (1997). "Assignment of SATB1 to human chromosome band 3p23 by in situ hybridization". Cytogenetics and Cell Genetics. 77 (3–4): 205–6. doi:10.1159/000134577. PMID 9284917.
Reddy PH, Stockburger E, Gillevet P, Tagle DA (Dec 1997). "Mapping and characterization of novel (CAG)n repeat cDNAs from adult human brain derived by the oligo capture method". Genomics. 46 (2): 174–82. doi:10.1006/geno.1997.5044. PMID 9417904.
Escalier D, Allenet B, Badrichani A, Garchon HJ (Jan 1999). "High level expression of the Xlr nuclear protein in immature thymocytes and colocalization with the matrix-associated region-binding SATB1 protein". Journal of Immunology. 162 (1): 292–8. PMID 9886398.
Liu J, Barnett A, Neufeld EJ, Dudley JP (Jul 1999). "Homeoproteins CDP and SATB1 interact: potential for tissue-specific regulation". Molecular and Cellular Biology. 19 (7): 4918–26. doi:10.1128/mcb.19.7.4918. PMC 84297. PMID 10373541.
Galande S, Dickinson LA, Mian IS, Sikorska M, Kohwi-Shigematsu T (Aug 2001). "SATB1 cleavage by caspaseستة disrupts PDZ domain-mediated dimerization, causing detachment from chromatin early in T-cell apoptosis". Molecular and Cellular Biology. 21 (16): 5591–604. doi:10.1128/MCB.21.16.5591-5604.2001. PMC 87280. PMID 11463840.
Kieffer LJ, Greally JM, Landres I, Nag S, Nakajima Y, Kohwi-Shigematsu T, Kavathas PB (Apr 2002). "Identification of a candidate regulatory region in the human CD8 gene complex by colocalization of DNase I hypersensitive sites and matrix attachment regions which bind SATB1 and GATA-3". Journal of Immunology. 168 (8): 3915–22. doi:10.4049/jimmunol.168.8.3915. PMID 11937547.
Durrin LK, Krontiris TG (Jun 2002). "The thymocyte-specific MAR binding protein, SATB1, interacts in vitro with a novel variant of DNA-directed RNA polymerase II, subunit 11". Genomics. 79 (6): 809–17. doi:10.1006/geno.2002.6772. PMID 12036295.
Yasui D, Miyano M, Cai S, Varga-Weisz P, Kohwi-Shigematsu T (Oct 2002). "SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances". Nature. 419 (6907): 641–5. doi:10.1038/nature01084. PMID 12374985.
Cai S, Han HJ, Kohwi-Shigematsu T (May 2003). "Tissue-specific nuclear architecture and gene expression regulated by SATB1". Nature Genetics. 34 (1): 42–51. doi:10.1038/ng1146. PMID 12692553.
Fujii Y, Kumatori A, Nakamura M (2004). "SATB1 makes a complex with p300 and represses gp91(phox) promoter activity". Microbiology and Immunology. 47 (10): 803–11. doi:10.1111/j.1348-0421.2003.tb03438.x. PMID 14605447.
Gocke CB, Yu H, Kang J (Feb 2005). "Systematic identification and analysis of mammalian small ubiquitin-like modifier substrates". The Journal of Biological Chemistry. 280 (6): 5004–12. doi:10.1074/jbc.M411718200. PMID 15561718.
Wen J, Huang S, Rogers H, Dickinson LA, Kohwi-Shigematsu T, Noguchi CT (Apr 2005). "SATB1 family protein expressed during early erythroid differentiation modifies globin gene expression". Blood. 105 (8): 3330–9. doi:10.1182/blood-2004-08-2988. PMID 15618465.
Seo J, Lozano MM, Dudley JP (Jul 2005). "Nuclear matrix binding regulates SATB1-mediated transcriptional repression". The Journal of Biological Chemistry. 280 (26): 24600–9. doi:10.1074/jbc.M414076200. PMID 15851481.
Nakayama Y, Mian IS, Kohwi-Shigematsu T, Ogawa T (Aug 2005). "A nuclear targeting determinant for SATB1, a genome organizer in the T cell lineage". Cell Cycle. 4 (8): 1099–106. doi:10.4161/cc.4.8.1862. PMID 15970696.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (Oct 2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038/nature04209. PMID 16189514.