أغاروز

هلام الأغاروز في صينية ليستخدم في الرحلان الكهربائي.

الأغاروز (بالإنجليزية: Agarose )‏ هوعديد سكاريد، يستخلص في العادة من بعض الطحالب الحمراء. وهومكثور خطي متكون من تكرار لوحدات الأغاروبيوز، وهوسكر ثنائي مكون من D-غلاكتوز و3،6-أنهيدرو-L-غلاكتوبيرانوز. الأغاروز أحد مكونين اثنين رئيسيين للأغار، ويُنقَّى من الأغار بإزالة المكون الآخر وهوالأغاروبكتين.

يُستخدم الأغاروز بشكل رائج في فهم الأحياء الجزيئي لفصل الجزيئات الكبيرة، خاصة الدنا عبر الرحلان الكهربائي. شرائح هلام الأغاروز من أجل الرحلان الكهربائي (في العادة 0.7-2%) يمكن تحضيرها بسهولة عبر سكب المحلول المائع الساخن في نطقب. مجال كبير من الأغاروزات المتنوعة في الوزن الجزيئي والخصائص متوفرة تجاريا لهذه الأغراض. يمكن تشكيل الأغاروز كذلك على شكل خزرات واستخدامها في الكثير من الطرق الاستشراب الخاصة بتنقية البروتين.

البنية

بنية مكثور الأغاروز.

الأغاروز مكثور خطي ذووزن جزيئي يصل حوالي 120 ألف دالتون، ويتكون من D-غلاكتوز و3،6-أنهيدرو-L-غلاكتوبيرانوز متناوبين مرتبطين عبر روابط غليكوسيدية α-(1→3) وβ-(1→4) . الـ3،6-أنهيدرو-L-غلاكتوبيرانوز هوL-غلاكتوز مع جسر أنهدروبين الذرة الثالثة والسادسة، توجد بعض وحدات L-غلاكتوز في المكثور لا تملك جسر الأنهدرو. يمكن مثيلة بعض وحدات D-غلاكتوز وL-غلاكتوز ويتواجد كذلك البيروفيك والكبريتات بكميات قليلة.

كل سلسلة أغاروز تحتوي على حوالي 800 جزيء غلاكتوز، وتشكل سلسلة مكثور الأغاروز خيوطا لولبية تتكدس إلى بنية فائقة الالتفاف نصف قطرها حوالي 20-30 نانومتر. هذه الخيوط شبه صلبة ومجال طولها كبير وذلك حسب هجريز الأغاروز. حين يتم تصليب الأغاروز تشكل خيوطه شبكة قنوات ثلاثية الأبعاد يتراوح قطرها بين 50-200 نانومتر وذلك حسب هجريز الأغاروز المستخدم، تراكيز عالية تعني قنوات ذات أقطار صغيرة. تتماسك البنية ثلاثية الأبعاد بواسطة روابط هيدروجينية وبالتالي يمكن تشتيتها عبر تسخينها وإعادتها إلى الحالة السائلة.

مراجع

^ Jeppson, J. O., C. B. Laurell, and Bi Franzen (1979). "Agarose gel electrophoresis". Clinical Chemistry. 25 (4): 629–638. PMID 313856. مؤرشف من الأصل في 16 مايو2019. صيانة CS1: يستخدم وسيط المؤلفون (link)
^ Agar نسخة محفوظة October 16, 2007, على مسقط واي باك مشين. at lsbu.ac.uk Water Structure and Science
^ "Agar". Food and Agricultural Organization of the United Nations. مؤرشف من الأصل في 24 ديسمبر 2018.
^ Rafael Armisen; Fernando Galatas. "Chapter 1 - Production, Properties and Uses of Agar". Fao.org. مؤرشف من الأصل في 20 ديسمبر 2018.
^ Tom Maniatis; E. F. Fritsch; Joseph Sambrook. "Chapter 5, protocol 1". Molecular Cloning - A Laboratory Manual. 1. صفحة 5.4. ISBN .
^ Alistair M. Stephen; Glyn O. Phillips, المحررون (2006). . CRC Press. صفحة 226. ISBN . مؤرشف من الأصل في 16 ديسمبر 2019.