ترنسكربيتوم

الترنسكريبتوم (بالإنجليزية: Transcriptome) هي مجموعة جميع جزيئات الرنا (RNA) التي تتضمن الرنا المرسال والرنا الريبوسومي والرنا الناقل وغيرها من أنواع الرنا غير المشفر التي يتم إنتاجها في خلية واحدة أوتجمع من الخلايا، تنتج جزيئات الرنا تلك من الدنا (DNA) . يمكن إطلاق هذا المصطلح على مجموعة النواسخ الكاملة في كائن ما أوعلى مجموعة فرعية محددة من النواسخ التي توجد في نوع خلوي معين. بعكس الجينوم وهوثابت تقريبا لخط خلوي معين (إذا ما استثنينا الطفرات)، يمكن حتى تتنوع مجموعة الترانسكربيتوم بتنوع الظروف البيئية. يعكس الترانسكربيتوم الجينات التي تم تعبيرها بنشاط في أي وقت محدد وذلك لأنه يضم جميع ناسخات الرنا في الخلية باستثناء ظاهرة تحلل الرنا المرسال مثل توهين الناسخات (بالإنجليزية: Transcriptional Attenuation).

يرمز إلى دراسة الترانسكريبتوم أيضا بصياغة التعبيرات (بالإنجليزية: Expression Profiling) والتي تفحص مستوى التعبير للرنا المرسال في تجمع خلوي محدد غالبا باستخدام تقنيات سلسلة عالية الإنتاجية تعتمد على تقنية مصفوفات الدنا الدقيقة. يعهد استخدام الجيل القادم من السلسلة لدراسة الترنسكريبتوم على مستوى النيوكليتويد بسلسلة الرنا.^[1]

إن الترانسكريبتوم هوفرع من الأحياء الجزيئية يتعامل مع دراسة جزيئات الرنا الرسول المنتجة في خلية أوتجمع من نوع خلوي معين.

التطبيقات والتحليل

يعتبر الترانسكربيتوم الخاص بالخلايا الجذعية وخلايا السرطان ذا أهمية خاصة للباحثين الذي يرغبون فهم عمليات التمايز الخلوي والسرطنة. أنشئت وشرحت مجموعة من قواعد البيانات التي تختص بترانسكربيتوم الكائن الحي بهدف المساعدة في تحديد الجينات التي تتمايز تعبيريا في تجمعات خلوية مميزة أوفرعية . على أي حال، فإن تحليل تعبير مستويات الرنا المرسال يمكن حتىقد يكون معقدا بسبب واقع حتى التغيرات البسيطة نسبيا في تعبير الرنا المرسال يمكن حتى تنتج تغييرات كبرى في كمية البروتين المرافق الكلية الموجودة في الخلية. تعهد إحدى طرق التحليل بتحليل تخصيب مجموعات المورثات وتقوم بتعريف شبكات الجين المنظمة التعاون بدلا من الجينات المفردة التي يتم حمل أوخفض تنظيمها في تجمعات خلوية مختلفة.^[2]

تنظيم الرنا المرسال

على الرغم من حتى دراسات المصفوفات الميكروية يمكنها حتى تكشف كميات الرنا المرسال النسبية المتنوعة في الخلية، فإن مستويات الرنا المرسال ليست متناسبة مع مستوى تعبير البروتينات التي ترمّز لها. يعتمد عدد جزيئات البروتين التي يتم توليفها باستخدام جزيء الرنا المرسال كنطقب بشكل كبير على مظاهر بادئ الترجمة لسلسلة الرنا المرسال، بشكل خاص فإن قدرة سلسلة بادئ الترجمة هي محدّد رئيسي في تجنيد الرايبوسومات في عملية ترجمة البروتين. يطلق لفظ البروتيوم على متمم البروتين الكامل في الخلية أوالكائن الحي.

كشفت دراسة أجريت على 158,807 ناسخ فأري حتى 4520 من هذه النواسخ تشكل شركاء مقاومة للحساسية هي متممات زوج قاعدي لإكسونات الجينات.^[3] تزيد هذه النتائج من احتمالية حتى تكون أعداد كبيرة من "جينات تكويد الرنا المقاومة للحساسية" مشاركة في تنظيم مستويات تعبير بروتين الرنا المرسال المشفر.

مراجع

^ "معلومات عن ترنسكربيتوم على مسقط universalis.fr". universalis.fr. مؤرشف من الأصل في 25 يوليو2019.
^ "معلومات عن ترنسكربيتوم على مسقط jstor.org". jstor.org. مؤرشف من الأصل في 20 أبريل 2020.
^ "معلومات عن ترنسكربيتوم على مسقط meshb.nlm.nih.gov". meshb.nlm.nih.gov. مؤرشف من الأصل في 22 نوفمبر 2019.

^ Wang Z, Gerstein M, Snyder M. (2009). RNA-Seq: a revolutionary tool for transcriptomics. Nature Rev. Genetics 10(1): 57-63.
^ Subramanian A, Tamayo P, Mootha VK, Mukherjee S, Ebert BL, Gillette MA, Paulovich A, Pomeroy SL, Golub TR, Lander ES, Mesirov JP. (2005). Gene set enrichment analysis: a knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles. Proc Natl Acad Sci USA 102(43):15545-50.
^ "Antisense Transcription in the Mammalian Transcriptome" by the RIKEN Genome Exploration Research Group and Genome Science Group (Genome Network Project Core Group) and the FANTOM Consortium: S. Katayama et al. in ساينس، Vol 309, Issue 5740, 1564-1566 , 2 September 2005.